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小麦TaPHYA基因亚家族的克隆及表达分析
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:作物学报
  • 时间:2012
  • 页码:1354-1360
  • 分类:S511[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]运城学院生命科学系,山西运城044000, [2]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081, [3]四川农业大学玉米研究所,四川雅安625014, [4]山西省农业科学院棉花研究所,山西运城044000
  • 相关基金:国家转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08010-002);国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2009CB118300);国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2008AA10Z121)资助 致谢:感谢美国堪萨斯州立大学小麦遗传与基因资源中心提供中国春缺体-四体材料N4A-T4D的种子.
  • 相关项目:拟南芥光敏色素B与光敏色素A在远红光中拮抗和蓝光中促进效应的分子机理研究
中文摘要:

光敏色素是一类与作物农艺性状密切相关的基因家族。本研究克隆了中国春小麦光敏色素TaPHYA1、TaPHYA2和TaPHYA3基因完整的编码序列,并对它们进行了生物信息学以及转录分析。在NCBI数据库中对其推测的氨基酸序列进行BLAST分析,发现TaPHYA1和TaPHYA3氨基酸序列中包含光敏色素基因完整的功能结构域。系统进化树分析表明,小麦TaPHYA1、TaPHYA2和TaPHYA3之间进化关系相近,且与单子叶植物玉米、水稻的PHYA聚为一个亚类。另外,TaPHYA的表达丰度具有组织特异性,在茎、叶、穗中表达量分别是根中的1.35、0.34和0.87倍;而在同光质条件下,其表达丰度也具有光质特异性,TaPHYA的总表达量在黑暗和远红光条件下最高,在蓝光条件下次之,而红光和白光条件下最低。该结果为深入研究小麦光敏色素A基因亚家族的功能奠定了基础。

英文摘要:

Phytochromes(PHYs) are important genes related to crop agronomic traits.In this paper,TaPHYA1,TaPHYA2,and TaPHYA3 were cloned from cv.Chinese Spring(Triticum aestivum L.).The putative domains of TaPHYA1,TaPHYA2,and TaPHYA3 proteins were predicted via the NCBI Protein BLAST.Either TaPHYA1 or TaPHYA3 is composed of a GAF domain,a PHYtochrome domain,two PAS domains,a His Kinase A domain,and a Histidine kinase-like ATPase domain.Phylogenetic tree analysis indicated that TaPHYA1,TaPHYA2,and TaPHYA3 are more close to PHYA members of monocot plants(ZmPHYA,SbPHYA,and OsPHYA) rather than to those of dicot plants(AtPHYA and GmPHYA).Expression profile of TaPHYAs were analyzed using semi quantitative RT-PCR and real time PCR assays.We found that the expression levels of TaPHYAs in stem,leaf and spike were 1.35,0.34,and 0.87 times of that in root,respectively.Additionally,TaPHYA showed high expression level in darkness,far-red,and blue light,but low expression level in red and white light conditions.The transcription of TaPHYA in the seedlings grown in the dark or far-red light was four or three times of that in seedlings grown in red light,respectively.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369