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棉铃虫类胰蛋白酶的生物信息学分析
  • ISSN号:0439-8114
  • 期刊名称:《湖北农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S433.4[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]西南交通大学生命科学与工程学院,成都611756
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31271302); 教育部中央高校基本科研业务费专项资金项目(SWJTU11CX114); 西南交通大学“希望之星”、SRTP项目(121632)
中文摘要:

对棉铃虫(Helicoverpa armigera L.)肠道内7种类胰蛋白酶的氨基酸序列进行了生物信息学分析。结果表明,棉铃虫7种类胰蛋白酶理化性质相近,含有丰富的Ala、Cys、Gly与Thr,均为可溶性蛋白酶,不稳定性较高。类胰蛋白酶分子中不存在跨膜结构域,含有特定的磷酸化位点,主要分布在细胞外基质与内质网中。棉铃虫类胰蛋白酶属于胰蛋白酶超家族成员,具有较高的氨基酸序列同源性,分子中含有保守的必需氨基酸残基,参与维持蛋白酶的空间结构及行使催化功能。分子进化研究表明类胰蛋白酶Ⅲ与类胰蛋白酶Ⅵ进化关系较近,而类胰蛋白酶Ⅰ和类胰蛋白酶Ⅱ在进化关系上更为接近。无规卷曲结构是类胰蛋白酶二级结构中的主要结构元件。

英文摘要:

Bioinformatic methods were used to analyze the amino acid sequences of 7 putative trypsins in the midgut of Helicoverpa armigera. The results showed that physical and chemical characteristics of these trypsins were very similar. Ala,Cys,Gly and Thr were abundant in these trypsins. These trypsins were soluble and relatively instable. They had no transmembrane structure and each trypsin had specific phosphorylation sites. They were mainly located in the extracellular and endoplasmic reticulum. These trypsins were belonged to the trypsin super family with highly homologous amino acid sequences. These trypsins consisted conservative residues participated in maintaining tertiary structure and catalytic process. Phylogenetic tree analysis showed that trypsin Ⅲ was similar to trypsin Ⅵ,and trypsin Ⅰ was more close to trypsin Ⅱ. Random coils were the major element in the whole secondary structure of these trypsins.

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期刊信息
  • 《湖北农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖北省农业科学院
  • 主办单位:湖北省农业科学院 华中农业大学 长江大学
  • 主编:焦春海
  • 地址:武汉市武昌南湖瑶苑1号省农业科学院内
  • 邮编:430064
  • 邮箱:hbnykxxzz@126.com
  • 电话:027-87389334
  • 国际标准刊号:ISSN:0439-8114
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1255/S
  • 邮发代号:38-21
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,全国农业核心期刊,湖北省优秀期刊,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30537