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褐虾过敏原Cra c 8蛋白的结构分析和同源建模
  • ISSN号:1002-6630
  • 期刊名称:《食品科学》
  • 时间:0
  • 分类:TS254.1[轻工技术与工程—水产品加工及贮藏工程;轻工技术与工程—食品科学与工程] Q617[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]中国海洋大学食品安全实验室,山东青岛266003
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30800859);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS.50)
中文摘要:

为了进一步认识褐虾中的一种过敏原——磷酸丙糖异构酶过敏原(Cra c 8)的结构与功能关系,理解食物过敏原之间产生交叉反应的分子基础,采用生物信息学方法分析Cra c 8蛋白的理化性质和各级结构,探讨其与食物中该蛋白质在分子水平上的异同。结果表明:褐虾Cra c 8蛋白是由249个氨基酸组成的酸性蛋白质,与螯虾、对虾、三文鱼、小麦、蟑螂中的磷酸丙糖异构酶蛋白具有较高的同源性,亲疏水性区域相似;二级结构预测结果显示其以α-螺旋和不规则折叠为主,均没有β-折叠及β-转角区域;利用同源建模的方式成功的构建褐虾Cra c 8蛋白的空间结构。

英文摘要:

To further understand the structure-function relationship of the allergen Cra c 8 of triosephosphate isomerase (TPI) from brown shrimps (Crangon crangon) and the molecular basis of cross reaction among food allergens, physical and chemical properties as well as the difference and similarity between Cra c 8 and other triosephosphate isomerases at molecular level were analyzed by a series of bioinformatics softwares. The results showed that Cra c 8 protein was an acidic protein composed of 249 amino acids. The homology of similar proteins was relatively high and hydrophobic and hydrophilic areas had great similarity in Archaeopotamobius sibiriensis, Fenneropenaeus chinensis, Salmo salar, Triticum aestivum and Blattella germanica. The prediction results of secondary structure showed that α -helix and irregular folds were the major structures of Cra c 8 protein, while β -sheet and β-comer regions were absent. The spatial structure of Cra c 8 protein was successfully built by homology modeling. This study will provide a theoretical reference for exploring the activity and cross-reactivity properties of brown shrimp Cra c 8 protein.

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期刊信息
  • 《食品科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国商业联合会
  • 主办单位:北京市食品研究所
  • 主编:孙勇
  • 地址:北京西城区禄长街头条4号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:foodsci@126.com
  • 电话:010-83155446-8006
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-6630
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2206/TS
  • 邮发代号:2-439
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,1986年原商业部重大成果三等奖,1997年国内贸易部优秀科技期刊三等奖,第三届中国出版政府奖提名奖,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:115579