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硇洲岛潮汐带牡蛎相关可培养细菌多样性
  • ISSN号:0253-2654
  • 期刊名称:《微生物学通报》
  • 时间:0
  • 分类:Q939[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]吉首大学生物资源与环境科学学院,湖南吉首416000, [2]云南大学省微生物研究所西南微生物多样性教育部重点实验室,云南昆明650091
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30970007); 国家重点基础研究发展计划项目(No.2010CB833800); 湖南省重点学科建设项目(No.JSU071312Z01); 湖南省高校科技创新团队支持计划项目(No.201208Z01); 吉首大学项目(No.11JDY060)
中文摘要:

【目的】了解南海硇洲岛潮汐带香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)相关可培养细菌的多样性。【方法】应用纯培养法分离样品中的细菌(含放线菌),采用基于16S rRNA基因序列的系统发育分析方法研究这些分离菌株的生物多样性。【结果】用补充0–25%(W/V)NaCl的MA、MH和NA培养基从样品中分离到102株细菌,在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取74个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析。结果表明,这些菌株归为38个物种,属于4个大的系统发育类群(Gamma-Proteobacteria,Alpha-Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes)的16个科、18个属。大多数菌株属于Gamma-Proteobacteria亚门(45株,60.8%),其余依次是Firmicutes门(12株,16.2%)、Bacteroidetes门(11株,14.9%)和Alpha-Proteobacteria亚门(6株,8.1%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的有效发表种典型菌株之间(16S rRNA基因序列相似性为94.3%–99.8%)存在一定的遗传差异,其中JSM 111069可能代表Carnobacteriaceae科的潜在新属;菌株JSM 111039和JSM 111085可能分别代表Bacillus属的两个新物种,菌株JSM 111020、JSM 111072和JSM 111090可能分别代表Pseudoalteromonas、Proteus和Idiomarina属的新物种。【结论】南海硇洲岛潮汐带牡蛎中存在较为丰富的原核生物多样性,并潜藏着一定数量的微生物新类群(物种)。

英文摘要:

[Objective] To investigate the diversity of cultivable bacteria isolated from Crassostrea hongkongensis collected from the tidal flat of Naozhou Island (20°52′-20°56′ N, 110°33′-110°38′ E) in the South China Sea. [Methods] Bacteria strains were isolated from homogenates of the sample by using conventional culture-dependent method, and then the isolated strains were investigated by using a phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequences. [Results] We isolated 102 bacteria strains from the sample on a number of media [MA (marine agar 2216), MH (moderate halophilic medium agar), NA (nutrient agar)] supplemented with 0-25% (W/V) NaCl. On the basis of the results of some morphological, physiological and biochemical tests, we selected 74 strains to perform a further phylogenetic analysis. Our results showed that the 74 isolates represented 38 species, belonging to 18 genera (Idiomarina, Morganella, Proteus, Halomonas, Paracoecus, Wohlfahrtiimonas, Marinobacter, Vibrio, Pseudoalteromonas, Shewanella, Oceanimonas, Nitratireductor, Myroides, Bacillus, Virgibacillus, Staphylococcus, Enterococcus, Trichococcus) of 16 families (Idiomarinaceae, Enterobacteriaceae, Halomonadaceae, Rhodobacteraceae, Xanthomonadaceae, Alteromonada- ceae, Vibrionaceae, Pseudoalteromonadaceae, Shewanellaceae, Aeromonadaceae, Phyllobac- teriaceae, Flavobacteriaceae, Bacillaceae, Staphylococcaceae, Enterococcaceae, Carnobacteri- aceae) in 4 phylogenetic groups (Gamma-Proteobacteria, Alpha-Proteobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes). The most of isolates were within the subphylum Gamma-Proteobacteria (45 strains, 60.8%), followed by Firmicutes (12 strains, 16.2%), Bacteriodetes (11 strains, 14.9%) and Alpha-Proteobacteria (6 strains, 8.1%). The phylogenetic analysis results suggested that there were obvious genetic divergences between most isolates and their closest type strains (16S rRNA gene sequence similarities ranged from 94.3% to 99.8%). The results also showed that, out

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期刊信息
  • 《微生物学通报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:赫荣乔
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路一号院3号中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:xuj@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807511
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2654
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1996/Q
  • 邮发代号:2-817
  • 获奖情况:
  • 1992年中国科学技术协会优秀学术期刊三等奖,1992年国家科委中共中央宣传部新闻出版署“全国优...,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:29487