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一株珊瑚礁-海草床复合生态系统固氮菌的分离与鉴定
  • ISSN号:0253-2654
  • 期刊名称:微生物学通报
  • 时间:0
  • 页码:962-968
  • 语言:中文
  • 分类:Q939.113[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院南海海洋研究所,广东广州510301, [2]中国科学院海南热带海洋生物实验站,海南三亚572000, [3]中国科学院研究生院,北京100049
  • 相关基金:国家科技支撑计划重点项目(No.2009BAB44803);国家自然科学基金项目(No.40776069,40676091);中国科学院知识创新工程重要方向项目(No.KSCX2-YW-G-075-10,KSCX2-SW-132);国家973计划项目(No.2010cB833800);海洋公益性行业科研专项经费项目(No.200705026);广东省科技计划项目(No.2004860302004,2005860301032)
  • 相关项目:南海北部海域“新”氮源输入的时空格局及其对季风的季节性响应
中文摘要:

三亚珊瑚礁自然保护区部分珊瑚礁退化后逐渐演替为以泰来藻(Thalassia hemprichii)为优势种的海草床群落,采用选择性无氮培养基从泰来藻植株的根际,分离得到一株固氮菌,编号为G33-1,经形态学、生理生化鉴定和16SrDNA及固氮基因nifH的序列分析,初步鉴定为成团泛菌(Pantoea agglomerans)。该菌为革兰氏阴性菌,以周生鞭毛运动,呈直杆状,菌落圆形,半透明乳白色,比较湿润,有光泽,直径约1mm,低凸,光滑,边缘比较整齐。最适培养条件为:氯化钠浓度25‰,生长温度为37℃,起始pH值为8。与成团泛菌标准菌株(ATCC27155^TM)相比较,在碳源利用、精氨酸双水解、苯丙氨酸脱胺酶、乌氨酸脱胺酶、以及生长温度和盐度等方面都具有较高的相似性,以16SrDNA为基础构建的系统进化树分析结果,表明其与成团泛菌属Pantoea agglomerans WAB1870进化距离最近,相似性大于99%。此外,利用乙炔还原法对固氮活性进行测定,其具有较高的固氮活性,达299.16nmol C2H2/(mL·h)。

英文摘要:

A strain capable of growth at high rates under nitrogen fixation conditions was isolated from the root of the seagrass (Thalassia hemprichii), which appeared after the degradation of coral reefs in Sanya natural reserves. The bacterium was identified as Pantoea agglomerans, which was also called Enterobacter agglomerans, on the basis of its morphology, physiological and biochemical characteristics, and the sequence analysis of 16S rDNA and the nitrogenase structural gene nifH. It was identified as a gram-negative, smooth, low raised, straight-rodded bacterium, which formed translucent colony with diameter of about 1 mm on the solid agar medium. Compared with the standard strain of the species Pantoea agglomerans (ATCC27155TM), there were high similarity in the carbon sources utility, hydrolysis and the optimal growth temperature and salinity, It could use a series of hydrocarbons as carbon sources, such as D-glucose, L-arabinose, sucrose, raffinose, maltose, rhamnose, D-xylose, D-mannitol, cellobiose, micronesia disaccharide. The results of the arginine dihydrolase, phenylalanine deaminase, lysine decarboxylation, ornithine deaminase were negative. The optimal growth temperature, pH and salinity were 37℃, 8 and 25‰, respectively. It could also grow at 40℃ and pH was 10 but could not grow at zero salinity. Phylogenetic analysis of the 16S rDNA gene sequences (EU841417) showed more than 99% similarities to that from other recognized Pantoea agglomerans. The nitrogen fixation rate of G33-1 was 299.16 nmol C2H2/(mL·h).

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期刊信息
  • 《微生物学通报》
  • 中国科技核心期刊
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  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
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  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2654
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1996/Q
  • 邮发代号:2-817
  • 获奖情况:
  • 1992年中国科学技术协会优秀学术期刊三等奖,1992年国家科委中共中央宣传部新闻出版署“全国优...,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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