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大白菜抽薹开花时间与SSR和InDel标记的关联分析
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:园艺学报
  • 时间:2012
  • 页码:1081-1089
  • 分类:S634.1[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]河北农业大学园艺学院,河北省蔬菜种质创新与利用重点实验室,河北保定071001
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31171976,31171964);教育部重点项目(209014)
  • 相关项目:耐抽薹大白菜—结球甘蓝单体异附加系EST-SSR分析及其FLC基因组成、表达研究
中文摘要:

利用57个SSR和InDel标记,对80份大白菜自交系及110份F1杂交种材料的基因组DNA进行扩增。通过群体遗传结构分析,将供试材料分为3个亚群体,亚群体的划分与群体遗传关系和性状相关联;采用TASSEL软件的GLM(generallinearmodel)方法进行标记与抽薹时间和开花时间的关联作图分析,发现13个标记的17个位点与抽薹时间和开花时间相关,其中15个与抽薹时间相关,12个与开花时间相关。10个位点同时与两个性状相关联。

英文摘要:

Fifty-seven markers of SSR (simple sequence repeat) and InDel (insertion-deletion) were used to amply the genome DNA of 80 inbred lines and 110 F1 hybrids of Chinese cabbage. Population genetic structure analysis showed that 190 Chinese cabbage accessions are composed of 3 subpopulations. The classification of subpopulations is associated with their genetic relationships and phenotypic traits. The association analysis of markers and bolting time, markers and flowering time were performed using GLM (general linear model) method of software TASSEL. A total of 17 alleles from 13 primers were identified as significant associations with bolting and flowering time, of which 15 alleles were associated with bolting time and 12 alleles were associated with flowering time. Furthermore, we found that 10 alleles were associated with two observed traits simultaneously.

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期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371