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在铜绿假单胞菌PAO1和PA14中确定基因岛的新方法
  • ISSN号：0023-074X
  • 期刊名称：《科学通报》
  • 时间：0
  • 分类：Q78[生物学—分子生物学] Q939.112[生物学—微生物学]
  • 作者机构：[1]教育部微生物代谢重点实验室,上海交通大学生命科学技术学院,上海200240, [2]上海师范大学生命与环境科学学院,上海200234
  • 相关基金：国家自然科学基金（批准号：30821005,30870075）、国家重点基础研究发展计划（编号：2009CB118906）和上海市重点学科（批准号：B203）资助项目
作者： 宋磊[1,2], 张雪洪[1]
关键词： 铜绿假单胞菌, 基因岛, 基因水平转移, 比较基因组分析, 整合酶
中文摘要：

基于基因岛的3种显著特点,建立了一种新的确定基因岛的方法,能够较为全面地搜寻特定菌株的基因岛.以此方法在Pse udomonas aeruginosa PA14和Pseudomonas aeruginosa PAO1中共发现了9个基因岛,在PAO1中发现2个,在PA14中发现7个,其中有4个是已经被研究鉴定,5个是新发现的基因岛.9个基因岛中,有6个的插入位点是tRNA基因,而其余的3个基因岛中有1个正向重复序列同tRNA基因相关,1个的正向重复序列是在GMP合酶/谷氨酰胺氨基转移酶双功能酶的3′末端,只有1个的正向重复序列尚不清楚来源.对5个未被鉴定的基因岛进行内部基因的功能分析,预测PA14GI-2是同汞离子摄取相关的基因岛,PA14GI-3是同分泌相关的基因岛,PA14GI-6是毒力岛.而PA14GI-1和PA14GI-5功能尚不清楚.对PAO1GI-1,PA14GI-5和PA14GI-7中的整合酶进行分析,预测了各基因岛的酶切位点和结合位点.

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期刊信息
  • 《科学通报》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院
  • 主编：周光召
  • 地址：北京东黄城根北街16号
  • 邮编：100717
  • 邮箱：csb@scichina.org
  • 电话：010-64036120 64012686
  • 国际标准刊号：ISSN：0023-074X
  • 国内统一刊号：ISSN：11-1784/N
  • 邮发代号:80-213
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘（网络版）,美国数学评论（网络版）,美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:81792