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甜樱桃DFR基因内含子2和内含子3的多态性
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S432.23[农业科学—植物病理学;农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]北京市农林科学院林业果树研究所,北京100093, [2]北京市大兴区兴海学校,北京100076
  • 相关基金:北京市自然科学基金项目(6073026); 北京市科技新星计划(2010B025); 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX201102003); 公益性行业(农业)科研专项经费(200903019)
中文摘要:

【目的】研究70个甜樱桃品种DFR基因多态性与果皮颜色的相关性。【方法】通过DNA序列分析,以不同果皮颜色的10个甜樱桃品种(Prunus avium L.)为材料,检测DFR基因的多态性。根据多态性出现的位点设计特异引物,通过PCR扩增检测70个甜樱桃品种DFR基因的多态性。【结果】获得甜樱桃DFR基因约1 kb的片段,测序结果用BLAST分析发现,其核苷酸序列与樱桃李(Prunus cerasifera)的核苷酸相似性为80%,预测的氨基酸序列与已知的甜樱桃(P.avium)DFR氨基酸序列相似性达99%。该片段由3个外显子和3个内含子组成,2个多态性位点分别在内含子2和内含子3上。在黄色、黄底红晕和红色果皮3个组的70个甜樱桃品种中发现3个单倍型,共5种单倍型组合。通过SAS 9.0软件分析发现,所检测到的DFR基因的等位基因频率在黄底红晕果皮品种组和红色品种果皮组中的分布无显著差异。【结论】本研究在甜樱桃DFR基因座上得到2个差异位点,分别在内含子2和内含子3内,其优势基因频率依次为:0.864和0.679;但未发现DFR基因内含子2和内含子3的多态性与果皮颜色之间存在直接关系。

英文摘要:

【Objective】 The relationship between polymorphism of DFR gene and pericarp colors was studied in 70 sweet cherry varieties.【Method】 DNA sequences analysis was applied to detect the polymorphism of DFR gene in 10 sweet cherry varieties(Prunus avium L.) of different colors in pericarp.Special primers were designed to amplify the polymorphic DNA fragments.70 sweet cherry varieties(P.avium L.) were used to test DFR gene polymorphism.【Result】 The DNA sequences of partial DFR gene about 1 kb were obtained from sweet cherry(P.avium).The identity of these DNA sequences was 80% with DFR gene of peach(Prunus persica).The identity of predicted amino acid sequences was 99% with the amino acid sequence of DFR in sweet cherry.This partial DFR gene contained 3 extrons and 3 introns.Two polymorphic loci were detected in intron 2 and intron 3.Three haplotypes and five haplotype combinations were found among 70 sweet cherry varieties which are composed of yellow pericarp group,yellow with a pink blush pericarp group and red pericarp group.There was no significant difference in the DFR gene frequencies between yellow with a pink blush pericarp group and dark red pericarp group.【Conclusion】 Two polymorphism loci were detected in intron 2 and intron 3 of DFR gene.Preponderatn alleles frequencies of 70 sweet cherry varieties was 0.864 in intron 2 and 0.679 in intron 3,respectively.There is no direct relationship between pericarp colors and polymorphisms DFR gene in intron 2 and intron 3.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620