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口腔扁平苔藓基因表达谱中差异表达基因初步探讨
  • ISSN号:1000-1182
  • 期刊名称:《华西口腔医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R781.5[医药卫生—口腔医学;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]南京医科大学口腔医学研究所,江苏南京210029, [2]南京中医药大学基础医学院免疫教研室,江苏南京210029, [3]南京医科大学附属口腔医院口腔颌面外科,江苏南京210029
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30472123);江苏省教育厅基金资助项目(04KJD320085)
中文摘要:

目的 筛选口腔扁平苔藓组织中的差异表达基因,并对其进行功能分类。方法 用4000种人类基因多聚酶链反应产物制成BiostarH-40s型表达谱芯片,分离纯化正常口腔黏膜组织和口腔扁平苔藓病变组织mRNA,制备表达谱探针,用ScanArray4000荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像,分析正常口腔黏膜组织和口腔扁平苔藓组织之间差异表达的基因。结果 1)在4000条基因中,有213条基因表达差异,其中122条基因表达上调,91条基因表达下调。2)在表达上调基因中,功能分类主要包括免疫相关基因、代谢相关基因、癌基因、细胞因子、细胞信号和传递蛋白。3)在表达下调基因中,功能分类主要包括DNA结合、转录和转录因子、细胞信号和传递蛋白、免疫相关基因、细胞因子、代谢相关基因。结论 口腔扁平苔藓的发生、发展过程中存在着多条不同功能基因表达调控的改变。

英文摘要:

Objective To detect the differentially expressed genes in oral lichen planus(OLP) by eDNA microarray. Methods The PCR products of 4 000 genes were spotted on chemical material coated glass plates in array. The total RNAs were isolated from OLP and normal oral mucosa tissue and were purified to mRNA. Both the mRNA were reversely transcribed to cDNA with the incorporations of fluorescent dUTP, for preparing the hybridization probes. The mixed probes were then hybridized to the cDNA microarray. Microarray was scanned for the fluorescent signals and showed the differences between the two samples. Results The expressions of 122 genes were up regulated while the expressions of 91 genes were down regulated in OLP among the 4 000 target genes. The upregnlated genes were mainly the ones of immunity related genes, metabolize related genes, oncogene, cytokine and cell signal transduction protein. The down-regnlated genes were mainly the ones of DNA binding and transcription factors, cell signal transduction protein, immunity related genes, metabolize related genes, and cytokine. Condusion Two hundred and thirteen differentially expressed genes with different functions were revealed in OLP, which may play some roles in the progression of OLP.

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期刊信息
  • 《华西口腔医学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:四川大学
  • 主编:陈谦明
  • 地址:四川省成都市人民南路三段14号华西口腔医学院教学楼8层
  • 邮编:610041
  • 邮箱:hxkqyxzz@vip.163.com
  • 电话:028-85503479
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1182
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1169/R
  • 邮发代号:62-162
  • 获奖情况:
  • 1992年获全国优秀科技期刊二等奖,1995年获四川省十佳期刊,1997年获全国优秀科技期刊三等奖,2000获四川省年第二届优秀期刊一等奖,2003年获第二届国家期刊奖百各重点期刊奖,2005年获教育部组织的全国高校科技期刊先进集体称号,2007年获第一届四川出版期刊奖一等奖,2008年获教育部中国高校精品科技期刊奖、教育部全...,2009年获第二
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16713