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双波长生物芯片荧光检测数据归一化方法研究
  • ISSN号:1005-0086
  • 期刊名称:《光电子.激光》
  • 时间:0
  • 分类:TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]上海理工大学光学与电子信息学院,上海200093, [2]上海理工大学计算机工程学院,上海200093
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划“973”资助项目(2005CB724300);上海市教委重点资助项目(05ZZ26);上海市重点学科建设资助项目(T0501);上海市教委青年基金资助项目(05EZ46)
中文摘要:

基于总值归一化法,通过顺序形态变换实现双色荧光图像数据的校正,对双通道检测的2种不同波长的Cy3、Cy5荧光图像进行了背景分析和归一化系数计算,数据分析显示双色荧光图像背景分割准确,依据其计算双色荧光校正信号,能消除检测通道(PMT)等因素造成的差异.该方法也适用于多波长荧光数据归一化.

英文摘要:

The differences in labeling efficiency and excited energy between two fluorescent dyes (Cy3, Cy5), gains and dynamic range between red and green channels result in the systematic variation in dual wavelength microarray scanning. A normalization method with order morphology filter is presented. The background estimations of each spot are done by percentile filtering after fluorescent micoarray gridding which is employed by minimum filtering. The result shows that the ratio of two-color fluorescent intensity could be corrected appropriately.

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期刊信息
  • 《光电子.激光》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:天津市教育委员会
  • 主办单位:天津理工大学 中国光学学会
  • 主编:巴恩旭
  • 地址:天津市西青区宾水西道391号
  • 邮编:300384
  • 邮箱:baenxu@263.net baenxu@aliyun.com
  • 电话:022-60214470
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-0086
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1182/O4
  • 邮发代号:6-123
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16551