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利用基因芯片筛选甘蔗成熟期叶片差异表达候选基因
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:《生物技术》
  • 时间:0
  • 分类:Q945.11[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]福建师范大学生命科学学院,福建福州350108, [2]农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室,福建福州350002
  • 相关基金:农业部现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-20-4-4),国家自然科学基金资助项目(30871575).
中文摘要:

利用Agilent甘蔗4×44k(perarray)芯片分析甘蔗叶片在甘蔗成熟期的差异表达基因,并通过生物信息学手段对基因芯片杂交结果进行分析。芯片杂交结果符合质控标准,并且杂交数据重复性良好,结果可靠。在甘蔗生长过程中8个时间点上,共筛选出相关差异在2倍以上的基因20个,其中上调表达基因17个,下调表达基因3个。这些候选基因分别涉及不同水平分子进程和多种代谢途径。

英文摘要:

In this study, Agilent sugarcane 4 ×44k (per array) genechip was used to identify the differentially expressed genes in the leaves of mature sugarcane, and bioinformatics tools were used for genechip hybridization analysis. Microarray hybridization re- sults met the quality standards, the data showed excellent reproducibility and the results were reliable. The differentially expressed genes were screened from the large number genes based on the bioinformatics analysis and microarray by ratio value≥2 during the 8 periods of sugarcane growth. The common differentially expressed genes were 20 ESTs including 17 of Up-regulated and 3 of downregulated ESTs genes. These genes involved in different molecular processes and a variety of metabolic pathways.

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期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
  • 地址:哈尔滨市道里区兆麟街68号
  • 邮编:150010
  • 邮箱:swjszz@163.com
  • 电话:0451-84615121
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503