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基于液相色谱质谱联用技术的肺癌细胞代谢组学分析
  • ISSN号:1000-8713
  • 期刊名称:《色谱》
  • 时间:0
  • 分类:O658[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]上海交通大学药学院,上海200240, [2]浙江中医药大学附属第一医院中心实验室,浙江杭州310006
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(21175092,21105064);国家重大科学仪器设备开发专项(2011YQ150072,2011YQ15007204,2011YQ15007207,2011YQ15007210);浙江省科技厅公益性技术应用研究计划(2011C37014);浙江省卫生高层次创新人才培养工程专项经费.
中文摘要:

通过高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱(HPLC-Q-TOF/MS)分别对肺癌细胞与正常细胞的机型与非极性代谢物进行指纹图谱分析,进一步应用偏最小二乘判别分析(PLS-DA)对代谢组学数据进行多维统计分析。研究结果显示,与正常细胞相比,肿瘤细胞存在异常的蛋白质、脂肪酸、磷脂代谢,并发现31种分类有显著贡献的代谢小分子物质。通过本研究,建立了基于液相色谱、质谱联用技术的肺癌细胞代谢组学分析方法,发现了肺癌潜在疾病标记物,可为肺癌分子标记物的发现及其早期诊断提供新思路和新方法。

英文摘要:

The metabolic profiles of the polar metabolites and the non-polar metabolites in lung tumor cell lines H358, A549, HCC827, H1299, Calu-3, Calu-l , PC-9 and normal cell line MRC- 5 were analyzed separately using high performance liquid chromatography-quadrupole time-of- flight mass spectrometry (HPLC-Q-TOF/MS). Partial least square discriminant analysis (PLS- DA) was used to process the metabolic data. The results showed that the metabolites of the lung cancer cell lines and normal cell line have significant differences. Further, l0 polar metab- olites and 21 non-polar metabolites which had a significant contribution to classification were selected and preliminarily identified due to the accurate mass. Comparing with the normal cell line. the lung tumor cell lines present an abnormal metabolism in protein, fatty acid, and phos- pholipids. These results may provide important information for the early diagnosis of lung cancer.

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期刊信息
  • 《色谱》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院大连化学物理研究所
  • 主编:张玉奎
  • 地址:大连市中山路457号
  • 邮编:116023
  • 邮箱:sepu@dicp.ac.cn
  • 电话:0411-84379021
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8713
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1185/O6
  • 邮发代号:8-43
  • 获奖情况:
  • 1998年获中国科学院科学出版基金择优支持(1998-2...,2001年获第四届中国科学院优秀期刊二等奖,2002年获第三届中国科协优秀期刊三等奖,连续多年被评为辽宁省一级期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:26730