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生物信息挖掘中LIS算法研究
  • ISSN号:1001-3695
  • 期刊名称:《计算机应用研究》
  • 时间:0
  • 分类:TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术] TP301.6[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]湖州师范学院信息工程学院,浙江湖州313000, [2]同济大学电子与信息工程学院,上海201804
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金资助项目(60573056);浙江省自然科学基金资助项目(Z106335,Y107759,Y107293);浙江省科技计划资助项目(2008C21083);湖州市科技攻关项目(2008GG11);湖州市科技计划资助项目(2007YZ08)
中文摘要:

探讨了生物信息挖掘中6模式子序列问题的一个特例,即最长递增子序列(LIS)问题。对于LIS问题,分别用LCS算法、动态规划、动态规划结合二分法进行求解,并分析了这三种算法的时间和空间复杂度,对其中两种算法进行了实现,验证了时间和空间复杂性理论分析的正确性,最后得出了一种高效的LIS算法。

英文摘要:

This paper introduced a special problem of 6 pattern subsequence in bioinformatics mining, that was LIS problem. This paper gave three algorithms of the LIS problem, they were LCS-based, dynamic programming, dynamic programming binary search, and analyzed the advantage and disadvantage of the three algorithms, and tested the performance of the three algorithms' complexity through experiment. Finally, it educed an effective LIS algorithm.

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期刊信息
  • 《计算机应用研究》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:四川省科学技术厅
  • 主办单位:四川省计算机研究院
  • 主编:刘营
  • 地址:成都市成科西路3号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:arocmag@163.com
  • 电话:028-85210177 85249567
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-3695
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1196/TP
  • 邮发代号:62-68
  • 获奖情况:
  • 第二届国家期刊奖百种重点科技期刊,国内计算技术类重点核心期刊,国内外著名数据库收录期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:60049