位置：立项数据库 > 立项详情页
考虑蛋白质柔性的分子对接算法与程序设计
  • 项目名称：考虑蛋白质柔性的分子对接算法与程序设计
  • 项目类别：青年科学基金项目
  • 批准号：20803022
  • 申请代码：B030204
  • 项目来源：国家自然科学基金
  • 研究期限：2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人：李洪林
  • 负责人职称：教授
  • 依托单位：华东理工大学
  • 批准年度：2008
中文摘要：

本课题发展了多套具有自主知识产权的药物筛选及设计方法，包括考虑蛋白质柔性分子对接程序、通用打分函数、分子相似形程序、药效团程序，已获软件版权4项；并以自主发展的程序和方法，针对一些与重大疾病相关的药物靶标开展药物发现等实验验证和应用，验证上述所发展的方法的同时获得了数十个先导化合物。相关成果已发表研究论文21篇，获得软件版权4项，申请发明专利20余项，已获得授权专利2项。获得先导化合物30余个，部分化合物已获得科技部新药创制重大专项的资助，开展候选药物及临床前研究。

中文主题词： 分子对接；虚拟筛选；打分函数；遗传算法；蛋白质柔性。
结论摘要：

英文主题词Molecular Docking; Virtual Screening; Scoring Function; Genetic Algorithm; Protein Flexibility.

成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 18
  • 4
  • 0
  • 0
  • 0
期刊论文
计算系统生物学:理论、方法及在药物研发中的应用
Investigation of the Catalytic Mechanism of Sir2 Enzyme with QM/MM Approach: SN1 vs SN2?
PharmMapper server: a web server for potential drug target identification using pharmacophore mappin
Discovery and SAR of Thiazolidine-2,4-dione Analogues as Insulin-like Growth Factor-1 Receptor (IGF-
Discovery of Novel Selective Inhibitors for EGFR-T 790M /L858R
A Novel, Customizable and Optimizable Parameter Method Using Spherical Harmonic for Molecular Shape
Accelerating All-Atom Normal Mode Analysis with Graphics Processing Unit
SHAFTS: A Hybrid Approach for 3D Molecular Similarity Calculation. 2. Prospective Case Study in the
SHAFTS: A Hybrid Approach for 3D Molecular Similarity Calculation. 1. Method and Assessment of Virtu
基于GPU的矩阵求逆性能测试和分析
Benzamide derivatives as dual-action hypoglycemic agents that inhibit glycogen phosphorylase and act
会议论文
先导药物发现新方法及应用
抗疟天然活性化合物的发现及其作用靶标确证
Falcipain-2抑制剂发现及作用机理研究
新型Falcipain-2靶向抗耐药抗疟先导化合物的发现
相关项目
基于XML的柔性分子对接模型及优化算法研究
期刊论文 31 会议论文 10
分子对接设计的并行算法研究
期刊论文 1 会议论文 12 著作 17
生物大分子受体与小分子配体的分子对接模型的研究
期刊论文 9
基于3S的水库诱发地震危险性分布式评价模型与方法研究
期刊论文 12 会议论文 17
针对肿瘤新生血管标志分子TIE2的PET分子影像探针的计算机辅助设计和开发
期刊论文 2
协同交互式进化计算关键技术及基于Internet的实现研究
期刊论文 39 会议论文 4 获奖 2 著作 1
蛋白质与蛋白质相互作用及对接方法的研究
期刊论文 17 会议论文 25 获奖 14
蛋白-配体亲合性打分函数的系统评估
期刊论文 9 获奖 5
新型AChEI美普他酚衍生物的计算机辅助设计，合成和药理研究
期刊论文 4 会议论文 3
李洪林的项目
　基于结合动力学的药物设计方法及新型DHODH抑制剂的发现
参加5th HOPE Meeting会议
药物设计与药物信息
期刊论文 102 会议论文 18
　基于结合动力学的药物设计方法及新型DHODH抑制剂的发现
　基于结合动力学的药物设计方法及新型DHODH抑制剂的发现
天然产物作用靶标识别计算方法及实验验证
期刊论文 98 会议论文 17 获奖 25
　基于药效团方法的药物发现中若干问题及算法研究