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牙鲆转录组中鳗弧菌抗性相关的SNP筛查及关联分析
  • 项目名称:牙鲆转录组中鳗弧菌抗性相关的SNP筛查及关联分析
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31101891
  • 申请代码:C190201
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2014-12-31
  • 项目负责人:于海洋
  • 依托单位:中国海洋大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

牙鲆是我国黄、渤海重要的经济鱼类,随着牙鲆养殖业,特别是高密度集约化养殖的蓬勃发展,牙鲆细菌性疾病日趋严重,成为制约养殖发展的重大障碍,因此改善其抗病相关性状是其遗传改良的重要目标。而筛选与牙鲆抗细菌性疾病相关的分子标记,用于辅助选择抗病牙鲆群体、家系,是牙鲆抗病育种的重要并可靠的途径。本项目拟利用选择育种中筛选分析候选基因的"候选基因生物信息学分析",系统分析我们已获得的牙鲆转录组测序ESTs,筛查与牙鲆与免疫和抗性相关的基因内部的SNP位点,并利用高分辨率熔解曲线技术,在所构建的牙鲆家系中,寻找对鳗弧菌病抗性有显著差异的家系,以此为材料进行SNP基因分型。筛选出敏感家系、抗性家系间以及敏感家系内死亡个体和成活个体间存在显著差异的SNP分子标记;并利用这些标记的基因型对于牙鲆鳗弧菌病的易感/抗性性状进行关联分析。确定获得的与牙鲆鳗弧菌病易感/抗病相关联的SNP分子标记。

结论摘要:

筛选与牙鲆抗细菌性疾病相关的分子标记,用于辅助选择抗病牙鲆群体、家系,是牙鲆抗病育种的重要并可靠的途径。本课题以牙鲆为主要研究对象,进行了牙鲆实验用家系的构建工作,利用这些牙鲆家系进行了鳗弧菌感染实验,筛选出了针对鳗弧菌的牙鲆敏感家系和抗性家系;开展了牙鲆免疫、抗病相关基因的克隆与表达分析,获得了抗性相关的多个基因;利用生物信息学的手段,在牙鲆抗性相关的基因中筛查到200余个SNP位点,利用高分辨率熔解曲线分析和重测序技术进行了SNP位点与敏感、抗病性状的关联分析,获得了牙鲆鳗弧菌感染前后具有显著差异的多个SNP位点;构建了牙鲆高密度遗传连锁图谱,进行了牙鲆抗病相关SNP位点在图谱的初步定位。本课题的结果为牙鲆抗病育种辅助选择提供了工具,进一步提高牙鲆抗病育种效率。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
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