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探寻X染色体的重组事件并构建东亚人群起源迁移研究的新模式
  • 项目名称:探寻X染色体的重组事件并构建东亚人群起源迁移研究的新模式
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:31071096
  • 申请代码:C0604
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:杨亚军
  • 负责人职称:讲师
  • 依托单位:复旦大学
  • 批准年度:2010
中文摘要:

染色体重组事件的发生率高于突变事件的发生率,群体进化问题的研究或可凭借重组信息来弥补原先突变信息SNPs等的不足。本项目拟运用X染色体重组信息(如重组发生的位置、先后等)研究东亚人群进化问题。在已完成的亚洲五个人群X染色体重组分析的基础上,再选择15个世居于东亚等地的代表人群,运用illumina高通量基因分型平台,对450个男性样本的X染色体18个区域中1536个SNP位点进行基因分型,使用新开发的重组分析软件(iRIS),从特定片段的高密度SNP基因分型数据中推断X染色体历史上发生的重组事件,并以此作为遗传标记,运用PCA、MDS、结构分析等研究方法或正在发展的重组分析的新方法,结合SNP位点的数据,组建人群X染色体重组事件系谱网络,从而构建解释东亚人群起源、迁移或人群重大事件的研究模式,并且对以往的研究成果进行全新的回顾和评价,本研究对医学遗传学、人类学等相关领域也将产生新的推动。

结论摘要:

本研究主要基于X染色体的研究视角,探讨人类群体进化问题。染色体重组事件的发生率高于突变事件的发生率,群体进化问题的研究或可凭借重组信息来弥补原先突变信息SNPs等的不足。本项目运用X染色体重组信息(如重组发生的位置、先后等)研究东亚人群进化问题。在已完成的亚洲五个人群X染色体重组分析的基础上,再选择15个世居于东亚等地的代表人群,运用illumina高通量基因分型平台,对450个男性样本的X染色体18个区域中1536个SNP位点进行基因分型,使用自己开发的重组分析软件(iRIS),从男性X染色体的特定片段的高密度SNP基因分型数据中,推断X染色体历史上发生的重组事件,并以此作为遗传标记,运用PCA、MDS、结构分析等研究方法,结合SNP位点的数据,组建人群X染色体重组事件系谱网络,从而构建解释东亚人群起源、迁移或人群重大事件的研究模式。 目前,我们的研究已经依据前期构建的亚洲人群X染色体重组事件系谱关系,整合我们所获得的东亚及东南亚15个代表人群的X染色体遗传多态数据,构建了高精度的东亚人群X染色体重组事件系谱网络;同时,参考Y染色体和线粒体研究成果,对东亚地区人群的进化关系和群体事件进行探讨。并与本实验室针对东亚人群的先期研究(主要指Y染色体和mtDNA数据)进行比较分析; 目前从技术上,已经完成了X染色体重组事件系谱网络的构建,主要是软件的开发和对海量数据的处理,也实现了如何从X染色体的SNP多态数据中找寻重组位点,并以此作为遗传标记,构建重组事件的系谱关系,从而探讨不同人群的基因交流和群体进化事件,相关成果以科研论文的形式发表于MBE、Hum genetic等SCI杂志上。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 3
  • 0
  • 0
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