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DNA多态性分型在肝癌家系X-染色体上寻找肝癌遗传易感基因
  • 项目名称:DNA多态性分型在肝癌家系X-染色体上寻找肝癌遗传易感基因
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30872503
  • 申请代码:H1617
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人:黄晓武
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:复旦大学
  • 批准年度:2008
中文摘要:

本研究选取中国江苏省启东地区汉族男性肝癌患者与对照,采用病例对照研究设计,应用基因芯片对其X染色体进行扫描,进行两个阶段的单核苷酸多态性(SNP)关联研究,以寻找与肝癌相关的新的遗传易感位点。我们分析了50例肝癌病例与50例慢性乙肝携带者的X染色体上的5454个SNP位点,发现在P<0.01的SNP中有多个SNP成簇分布在Xq22.1和Xq26.2这两个区段上。我们从上述两个区段中重新挑选出35个具有代表意义的标签SNP,应用质谱分析的方法对290例患者与242例对照进行基因分型研究,发现位于Xq22.1上的SNP位点rs5945919与肝癌相关(P<0.05)。rs5945919位于基因NXF3附近,为了研究NXF3基因与肝癌的相关性,我们分析了NXF3在肝癌组织与癌旁组织的蛋白表达差异,发现NXF3在癌组织表达明显高于癌旁组织(P<0.05)。进一步分析表明肝癌组织高表达NXF3的病例的总体生存和术后无瘤生存时间明显短于低表达NXF3的病例。我们的研究提示Xq22.1可能是肝癌新的遗传易感位点,X连锁基因NXF3可能是肝癌的独立预后因子。

结论摘要:

英文主题词hepatocellular carcinoma;single nucleotide polymorphisms;X chromosome;Xq22.1;NXF3


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