DNA甲基化与染色质修饰在基因组层面对表观遗传控制发挥重要作用,它们决定着染色质结构与基因表达。最近发现的5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)可能有助于理解表观遗传控制的过程。小鼠中三种双加氧酶Tet1, Tet2和Tet3都能介导5-甲基胞嘧啶(5mC)转化为5hmC。因此Tet家族基因可能与多能性状态相关,并且对于多能性的维持起重要的作用。我们的研究结果显示Tet3介导的5mC到5hmC的转变过程参与小鼠雄原核和甲基化质粒的主动去甲基化。诱导多能干细胞(iPS)的出现,为研究体细胞重编程和疾病治疗提供了一个崭新的方法。目前iPS诱导过程中表观遗传学的动态变化过程还不清楚。本项目在我们前期研究工作的基础上,通过分析iPS诱导过程中DNA甲基化的动态变化,旨在确定iPS细胞诱导过程中外源基因和内源基因甲基化的动态变化过程,并对Tet家族基因在iPS细胞诱导以及iPS多能性维持中的作用进行深入研究。
induced pluripotent stemm cell;DNA methelation;Tet genes;RNA interference;pigs
诱导多能干细胞 (iPS) 开创了再生医学研究的新领域,对生物医学研究和畜牧业生产具有重要意义,但诱导效率低、细胞重编程机制不清仍是制约其应用的瓶颈。本项目利用诱导多能干细胞技术以及RNA干扰技术,旨在研究Tet1基因在猪iPS特性维持中的作用。主要研究结果如下(1)将猪胚胎成纤维细胞(PEF)重编程为piPS。piPS克隆表达OCT4、SOX2、NANOG、REX1和SSEA4等干细胞标记。piPS在体外能形成表达三胚层标记基因Afp、Bmp4、Gfap的拟胚体。piPS在裸鼠皮下形成畸胎瘤,拟胚体包括外胚层起源的神经上皮,中胚层起源的血管、横纹肌,内胚层起源的滤泡样结构;(2)筛选出了2种能有效干扰Tet1表达的siRNA。Tet1表达下调后,piPS失去自我更新状态,开始分化并影响基因表达。其中谱系分化相关基因Pitx2、Hand1、Gata6和Lef1表达上升,多能性相关基因Lefty2、Klf2、Sox2表达下降;(3)Tet1表达下调后,影响piPS中DNA甲基化状态,其中Oct4、c-Myc启动子区域5mC含量明显上升,Sox2、Nanog启动子区域5mC含量没有变化,Klf4启动子区域5mC含量轻度上升;全基因组水平的5mC含量上升,而5hmC含量下降。本项目通过研究siRNA瞬时干扰piPS中Tet1基因表达后DNA甲基化及基因表达的状态,证实了Tet1基因在piPS多能性维持中发挥重要作用,为阐明猪iPS多能性网络调控和维持机制提供了重要的理论和实验依据。