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鼻咽癌去甲基化细胞模型的建立及cDNA芯片技术高通量筛选鼻咽癌甲基化谱的研究
  • 项目名称:鼻咽癌去甲基化细胞模型的建立及cDNA芯片技术高通量筛选鼻咽癌甲基化谱的研究
  • 项目类别:地区科学基金项目
  • 批准号:30660197
  • 申请代码:H1625
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人:黄光武
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:广西医科大学
  • 批准年度:2006
中文摘要:

鼻咽癌倾向于表观遗传学疾病,鼻咽癌特异性肿瘤抑制基因的启动子区CpG岛高甲基化导致其转录表达下调甚至沉默,丧失肿瘤抑制功能,成为鼻咽癌发病的重要机制。系统化规模化的寻找甲基化基因并建立鼻咽癌甲基化谱,对深入了解鼻咽癌的表观遗传学发病机制与及早期分子诊断技术的开发有重要意义。本研究利用DNA甲基化转移酶抑制剂结合脱乙酰基酶抑制剂对鼻咽癌细胞CNE2,HONE1进行去甲基化处理,通过cDNA芯片高通量规模化的筛选,经处理后表达上调的基因(≥2倍)共1480个,结合两芯片相同上调基因(≥2倍)567个;进一步筛选含有CpG岛的基因536个,去除X染色体上的基因47个,最终确定鼻咽癌的甲基化谱需筛选的479个基因。我们从中挑选了部分基因如P14,P15,P16,FSTL1,UCHL1,SPARC,TFPI2等一批基因,用半定量RT-PCR方法检测他们在鼻咽癌细胞和组织中的表达下调,而在正常组织中能正常表达。再利用亚硫酸氢盐测序法和甲基化特异性PCR法检测鼻咽癌细胞和组织中这些基因是呈高甲基化的,初步建立鼻咽癌的甲基化谱。

结论摘要:

英文主题词nasopahryngeal carcinoma, methylation, methylation profile


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