本课题组以重大疾病发生、发展、转归过程分子机理为中心,对包括遗传病、肿瘤、感染性疾病、心血管疾病、糖尿病、神经精神疾病等在内的多种重大疾病易感基因和致病突变、分子病理做了系统筛选和分析。鉴定了V型并指/趾症相关HOXD13p.Q317R突变、Marie Unna稀毛症相关U2HR等突变及其致病机理。发现MR-1和IC53分别与心肌肥厚和单纯收缩期高血压发病相关,而A20, SIRT1和PON基因簇则起保护心肌、抑制动脉硬化和稳定斑块等保护性作用。课题组还建立了多种分析复杂疾病基因联合作用的多位点分析方法,在"病例-对照"组群样本中研究复杂疾病相关SNP和SNP单倍型及致病机理。分化发育失调是疾病的重要基础,我们对糖脂代谢、精子发生、造血分化等生理过程的遗传和表观遗传调控网络也做了较深入的工作。鉴定了多个具有重要生理功能的基因,为多种疾病治疗提供了靶标;对ncRNA和染色质高级构象做了较系统的研究,鉴定了多个与造血、肿瘤发生、糖尿病及肌肉发生相关miRNA和ncRNAs。并对以珠蛋白基因簇为代表的成簇基因高级染色质构象组织及功能有了较深入的认识。