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Genome-wide distribution of histone H3 acetylation in all-trans retinoic acid induced neuronal differentiation of SH-SY5Y cells
  • ISSN号:0023-074X
  • 期刊名称:《科学通报》
  • 时间:0
  • 分类:Q421[生物学—神经生物学;生物学—生理学] S511[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]National Laboratory of Medical Molecular Biology, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Institute of Basic Medical Sciences, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing 100005, China
  • 相关基金:Supported by National Natural Science Foundation of China (Grant Nos. 90408007 and 30721063) and National Key Basic Research and Development Program of China (Grant No. 2004CB518605)
中文摘要:

与染色质免疫降水(薄片) 和 DNA 微数组分析的倡导者(ChIP-on-chip ) ,我们分析了乙酰化作用的变化在上嘘在 all-trans retinoic 酸(RA ) 的一 H3 导致了 neuronal 房间区别。Neuroblastoma SH-SY5Y 房间为 24 h 和乙酰化作用与 RA 被对待在上嘘在基因的倡导者区域的一 H3 被检测。结果显示出那,在处理以后,乙酰化作用在上的水平嘘在染色体在 597 基因提高,并且控制与那些相比在另外的 647 基因减少了的一 H3。在摘要,我们成功地采用了一种高产量技术检测并且分析乙酰化作用的变化嘘在在 RA 的早噬菌体的人的染色体的一 H3 导致了 SH-SY5Y 房间的 neuronal 区别。

英文摘要:

With chromatin immunoprecipitation (CHIP) and promoter DNA microarray analyses (ChiP-on-chip), we analyzed the variations of acetylation on histone H3 in all-trans retinoic acid (RA) induced neuronal cell differentiation. Neuroblastoma SH-SY5Y cells were treated with RA for 24 h and the acetylation on histone H3 in the promoter region of the genes was detected. Results showed that, after treatment, the level of acetylation on histone H3 elevated in 597 genes in the genome, and reduced in the other 647 genes compared with those of the control. In summary, we have successfully adopted a high throughput technique to detect and analyze variations of acetylation of histone H3 in human genome at the early phage of RA induced neuronal differentiation of the SH-SY5Y cells.

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期刊信息
  • 《科学通报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院
  • 主编:周光召
  • 地址:北京东黄城根北街16号
  • 邮编:100717
  • 邮箱:csb@scichina.org
  • 电话:010-64036120 64012686
  • 国际标准刊号:ISSN:0023-074X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1784/N
  • 邮发代号:80-213
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:81792