结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤(ENKTCL-N)是一组形态特殊、免疫表型独特、生物学行为呈高侵袭性的肿瘤,且与EB病毒感染高度相关。目前该肿瘤发生和演进的分子机制仍不清楚。全外显子组测序(WES)技术能检测出待测组织发生的所有外显子基因的突变,是目前研究致病基因突变机理较为理想的技术手段。WES用于肿瘤发病机制的研究已经取得了一些成就,但至今为止,国内外尚未见到WES用于NK细胞肿瘤的相关研究报道。本课题拟采用WES技术了解ENKTCL-N的整体基因突变情况,筛查出2~4个候选致病基因,进而对一组ENKTCL-N石蜡样本进行所筛查出的候选致病基因的测序分析及表达研究,观察有关致病基因与ENKTCL-N肿瘤细胞的增殖、侵袭及扩散等恶性生物学行为的关系,并研究可能与候选基因相关的信号通路,旨在寻找ENKTCL-N的致病基因,为该肿瘤的分子靶向治疗提供理论依据。
extranodal NK/T cell lymphoma;whole exome sequencing;gene mutation;;
本课题研究分4个部分(1)收集了20例鼻ENKTCL-N新鲜肿瘤组织和相应的外周血标本以及200例不同部位的ENKTCL-N石蜡包埋肿瘤组织样本;(2)完成了所收集样本的全基因组DNA的提取;(3)对2对ENKTCL-N样本进行了全外显子组测序及分析,筛选出了16个突变基因作为候选基因进行验证,其中包括涉及细胞粘附、分裂周期、增殖信号通路和离子通道等各方面的关键基因;同时对200例ENKTCL-N石蜡包埋组织进行基于PCR的Sanger测序,验证候选基因的突变情况,为下一步研究ENKTCL-N的分子机制奠定了基础;(4)对200例提供ENKTCL-N石蜡包埋肿瘤组织样本的患者进行了临床病理资料的收集和整理,并分析候选基因突变与ENKTCL-N的临床病理表现及预后的关系,综合分析所研究的基因在ENKTCL-N中的可能作用。本课题研究工作按时完成,但数据分析、整理及论文撰写等工作还在进行中。在该课题的资助下,截止至2013年12月,已发表3篇文章,其中SCI论文2篇,中文核心期刊1篇。