近期研究表明,miRNA基因的SNPs可能改变其对靶基因的调控功能,并提示这一机制可能与鸡个体之间和品种之间抗病能力的差异密切相关,为我们挖掘地方鸡种的特有抗病基因提供了一条新思路。因此,本项目以前期构建的miRNA SNPs数据库为基础,以河北柴鸡和引进蛋鸡品种来航鸡为研究对象,选择绵羊红细胞免疫抗体滴度、异嗜性粒细胞与淋巴细胞比率、血清白细胞介素(IL-2、IL-6、IL-8)水平等为主要目标性状,采用CRS-RFLP等技术检测miRNA基因型,筛选与目标性状紧密关联的SNPs及其组合。在此基础上,采用一系列细胞、分子生物学方法,探讨SNPs对miRNA基因表达的影响及其分子机制。结合基因表达芯片检测和生物信息学预测,筛选出与河北柴鸡的免疫应答能力相关的且受miRNA调控的候选靶基因,为最终阐明遗传变异影响地方鸡种抗病性状形成的分子机理奠定基础,为我国抗病优质鸡的培育提供新的理论基础。
chicken;immune;microrna;deep sequencing;SRBC
家禽抗病育种研究是近年来研究的热点,挖掘我国地方鸡种特异性抗病基因培育抗病新品种是一直家禽育种学家追求的重要目标。本项目以北京油鸡、柴鸡和来航鸡为研究对象,以抗病性密切相关的SRBC抗体滴度为主要目标性状,采用高通量测序技术测定脾脏SRBC免疫应答的microRNA/mRNA表达谱,构建了3个鸡种特异免疫应答调控网络,并筛选出品种间免疫应答能力差异相关的候选基因,进而通过H/L、IL-2、IL-6、IL-8、免疫器官指数等免疫指标关联和生物信息学分析,初步筛选出部分与之相关候选SNP标记。同时,还比较了3个鸡种主要免疫器官等在免疫SRBC后组织水平变化和差异。