癌相关通路间共扰动关系在癌症的发生与发展过程中发挥重要作用。然而,受癌基因组高度异质性、很多基因未注释到已定义的通路中等因素限制,目前缺乏对癌相关功能协同变异机制的系统研究,制约着癌基因识别和癌症药物联合靶向治疗等研究。本项目拟整合癌基因组体细胞突变谱和拷贝数改变谱,设计在蛋白质互作网络中搜索癌相关协同改变的功能模块对的方法;结合microRNA表达谱、甲基化谱和基因表达谱,论证模块间不同的协同变异机制影响不同的癌症病人,揭示癌基因组高度异质性表象后一致的功能协同变异关系;根据模块间基因改变的相关性,设计寻找候选癌基因的有效方法。本项目的研究结果不仅证实癌基因组中广泛存在的癌通路间协同改变的现象,而且提出特定癌相关功能模块间冗余模型和累加模型,揭示经典癌通路在信号传导过程中的协同作用。通过探讨不同的协同变异模型,可以为设计癌症的个体化联合靶向治疗方案提供理论基础。
英文主题词Cancer genome;Cancer gene;Collaborative alteration;Functional module;Biomarker