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家族性皮质性震颤伴癫痫致病基因的寻找、确认与功能研究
  • 项目名称:家族性皮质性震颤伴癫痫致病基因的寻找、确认与功能研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81171223
  • 申请代码:H0913
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:洪震
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:复旦大学
  • 批准年度:2011
中文摘要:

家族性皮质震颤伴癫痫(FCTE)是一类具有临床和遗传异质性的神经遗传病,主要表现为皮质性震颤与癫痫发作。FCTE 的致病基因迄今尚未克隆。本课题组已收集两个明确诊断的FCTE家系,拟采用连锁分析对3个已知的有关染色体区域的排除性定位分析,若与已知位点连锁则进行精细定位查找致病基因;若排除已知位点,则进行全基因组外显子测序与全基因组SNP Array 6.0芯片扫描,从多途径、多角度着手,快速查找新的FCTE疾病基因位点抑或存在的拷贝数变异;筛选新位点区域已克隆的相关基因作为候选基因,对相应的FCTE 家系进行突变分析,确定FCTE 致病基因。并根据致病基因的结构和功能特点,进一步进行功能分析,研究突变型与表型的关系,探讨基因突变致FCTE 的机理,为揭示原发性癫痫的发病机制及开发新的抗癫痫药物提供理论依据。

结论摘要:

常染色体显性遗传皮质性震颤伴癫痫(autosomal dominant cortical tremor and epilepsy, ADCTE)是一种常染色体显性遗传的,主要以四肢远端震颤、肌阵挛伴或不伴全面强直-阵挛发作的癫痫综合征。既往的研究将ADCTE家系的致病基因分别定位于8q23.3-q24.1、2p11.1-q12.2与5p15.31-p15。我们通过全基因组外显子测序结合连锁分析查找ADCTE的致病基因。明确家系诊断后,采集家系成员(患者5例,正常人11例)外周血,提取DNA。在2p11.1-q12.2区域选取5个,5p15.31-p15区域4个以及8q23.3-q24.1区域10个微卫星标记,进行部分性基因组扫描。采用LINKAGE 软件包v5.1中Mlink软件进行两点间连锁分析,计算LOD值。并利用Cyrillic 2.1软件,对含有基因扫描数据的家系文件进行单体型分析。根据单体型在患者个体中共享的情况,并根据交换的发生可得到最终由所有患者共享的一段最小区域。从ADCTE家系中挑选2个病例、1个正常对照进行全基因组外显子测序。通过PCR测序方法,将筛选得到的致病基因及其突变位点在家系内的另外3例患者与11例正常对照进行家系内验证,之后,在更大范围的正常人群中验证在前两步中发现的存在于候选致病基因中的所有功能突变。结果发现,常染色体显性遗传皮质性震颤伴癫痫家系诊断明确,临床表型一致性好,是理想的遗传学资源。在常染色体显性遗传模式下,设定疾病外显率为100%,重组率e为0时,而8号染色体上的D8S1779的两点LOD值为2.35。通过全基因组外显子测序筛选与验证,我们发现5名患者都存在PKHD1L1基因exon23:c.2602A>T杂合突变,11名对照均为纯合子,存在共分离现象。该突变位点在正常人群中不存在。从而在遗传学上初步证实 PKHD1L1c.2602A>T 为该家系的致病突变。本研究采用最先进的全基因组外显子测序方法,成功发现了常染色体显性遗传皮质性震颤伴癫痫的致病基因PKHD1L1,并进一步证实了全基因组外显子测序为一种发现稀有单基因疾病致病基因有力、有效的方法。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 4
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
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