胃癌是我国人群中发病率和死亡率均占第一位的恶性肿瘤,贲门癌在胃癌中的比例及发病率在国内外均呈逐年上升趋势,在过去10年间增加近6倍。研究表明,贲门癌的基因改变可能接近于食管癌,但相对于其它部位胃癌仍表现自身特异性。贲门癌细胞中频发染色体4q和18q缺失或丢失,提示染色体4q和18q区域存在与贲门癌发生、发展密切相关的抑癌基因,其失活可能代表贲门癌的分子病理学特征。本项目拟采用激光捕获显微切割(LCM)技术从贲门癌组织中分离、纯化肿瘤细胞,通过高密度微卫星标记进行LOH分析,精确定位染色体4q区域抑癌基因;同时,应用DHPLC技术直接在贲门癌中进行染色体4q区域AGO和Cyclin G2基因以及染色体18q21抑癌基因SMAD4/DPC4的突变鉴定。本项目旨在发现新的代表贲门癌分子病理学特征的抑癌基因,为贲门癌高危个体监测或早期诊断提供基因标志,进而提供贲门癌基因治疗靶点。
本课题首先利用激光捕获显微切割(LCM)和全基因多重置换扩增(MDA)技术,建立了检测微量细胞基因组中多个位点杂合性丢失(LOH)的方法,克服了以往同类研究中混杂细胞对实验结果的干扰,提高了实验的准确性。进而系统地检测了贲门癌和远端胃癌中4q、18q、8p21-p23、1p35-pter等染色体区域的LOH情况。根据染色体的部分缺失情况,分别为贲门癌确定了4个共同丢失区域,为远端胃癌确定了5个共同丢失区域。我们发现两种肿瘤间存在着较为显著的差异,这些区域内可能存在着与贲门癌和远端胃癌发生发展相关的抑癌基因。对其中的候选基因SMAD4、AGO、EPHB2、CCNG2/CyclinG2、KIAA1456等进行研究后发现,两种肿瘤中SMAD4失活情况存在着显著的差异,远端胃癌中SMAD4失活的频率要显著地高于贲门癌。这提示SMAD4基因与贲门癌的关系并不像胃癌那样密切。另外,我们利用生物信息学的方法发现了一个新的胃癌相关基因ANXA10。我们的结果提示可能有不同的抑癌基因参与了贲门癌和远端胃癌的发生发展过程,同时也为今后的深入研究提供了参考方向。