特应性皮炎(AD)是皮肤科常见疾病,是一种慢性复发性、瘙痒性、炎症性皮肤病,给患者生活带来长期困扰。本病原因不明,是由遗传因素与环境共同作用的一种复杂疾病。全基因组关联分析研究(GWAS)是目前发现复杂疾病易感基因的有效方法。本课题组前期收集到大量AD和对照样本,利用高通量Illumina Human 610-Quard SNP分型芯片对中国汉族人1012例AD和1119例对照进行全基因组关联分析,结果提示有多个提示意义的易感基因位,并发现在低年龄组、伴发哮喘组及伴发过敏性鼻炎组均有显著易感区域。本研究拟利用Sequenom和TaqMan平台对另外独立人群3000例和4000例正常对照进行验证,确定易感基因位点,利用测序方法进行易感基因的精细研究,结合基因功能验证,确定AD易感基因,为解释AD的发病机制、基因诊断、疾病预后评估,个体化治疗提供理论依据。
Atopic dermatitis;complex disease;Gene;Susceptibility;Genome Wide Association Study
特应性皮炎(atopic dermatitis,AD)是一种常见的瘙痒性、慢性复发性炎症性皮肤病,具有高IgE倾向,易伴发哮喘、过敏性鼻炎,多见于儿童和青少年。本病病因和发病机制尚不清楚,目前尚缺少彻底治愈该病的药物和措施,常给患者身心健康带来很大影响,并给家庭造成较大经济负担。国内外通过大量的人群、家系及双生子研究均表明遗传因素是构成AD易感性的主要因素,且发病与饮食、环境、药物、感染等多种因素有关,属多基因遗传疾病。本课题首先对中国汉族人1012例AD患者和1362例对照进行了全基因组关联分析(Genome Wide Association Study, GWAS),根据得到的初步结果,在中国人群中3624例AD患者和12197个对照中利用Sequnom和Taqman平台进行验证,发现了两个新的位点5q22.1 (TMEM232 and SLC25A46) 和20q13.33(TNFRSF6B/ZGPAT),证实了以前报道基因FLG基因。并在德国1806例患者和3256例对照中进行了验证,发现了20q13.33与德国人群AD发病有相关性。 AD、过敏性鼻炎、哮喘同属于特应性疾病,均与遗传过敏素质有关,根据我们前期的GWAS研究结果,通过基因功能相关分析,选择可能与哮喘、过敏性鼻炎相关的10个SNP位点,在这两种疾病中利用sequnom平台进行验证,结果发现 14q11.2和哮喘显著相关,5q22.1 GGGA为哮喘的提示危险单倍型,11q13.5 和20q13.33与哮喘无关;14q11.2 上的rs4982958位点与过敏性鼻炎有显著的相关性,并且影响着过敏性鼻炎的临床表型。本项目首次利用GWAS方法在大样本汉族人群中对AD进行了研究,发现5q22.1区域(TMEM232/SLC25A46)和20q13.33(TNFRSF6B/ZGPAT)为中国汉族人群AD的致病基因,并构建了AD基因和表型资料库,为发现AD易感人群、目标基因、风险评估、临床诊断治疗及新药研发提供理论依据。 本项目发表 SCI 论文3 篇,中文核心期刊综述3 篇,病例报道2篇。