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中国近海鮸鱼遗传多样性的细胞色素b全序列分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S917.4[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]暨南大学水生生物研究所,广东广州510632
  • 相关基金:国家自然科学基金(41071034,30770415);科研培育基金(21611426)
中文摘要:

分析了中国近海连云港、舟山和福州38胜鮸鱼线粒体细胞色素b(Cytb)基因的1140bp序列,共检测到39个变异位点和5个简约信息何点;共有27个单倍型,总的单倍型多样性为0.960±0.020,核苷酸多样性为0.00271±0.00030,表现为高单倍型多样性和低核苷酸多样性;Tajima’S中性榆验为负值且显著(-2.36010,P〈0.05),在简约性网络图中单倍型呈星状分布,核苷酸不配对分析呈单峰曲线,表明中国近海觑鱼经历过种群扩张,推测扩张年代约为8万年前。在邻接树和简约性网络图中不同地理来源的单倍型交错分佰,群体间有较低的FST值(-0.0190~0.0081)和较高的Nm值(-62.53~26.82),分子方差分析(群体间-1.12%)表明群体问未出现明显的遗传分化,可作为一个管理保护单位.推测兢鱼生活史中存在一定规模的洄游以及扩张后的群体尚未在迁移与漂变间达到平衡是未榆测到垃著地理和谱系结构的主要原因。

英文摘要:

Complete sequences of mtDNA Cytochrome b gene (1 140 bp) of 38 individuals of Miichthys miiuy collected in Lianyungang, Zhoushan and Fuzhou along coastal waters of China were analyzed, of which 27 haplotypes were defined by 39 variable 'sites And 5 parsimony-infiormative sites. The global haplotype diversity (Hd) and nucleotide diversity (Pi) were 0.960±0.020 and 0.00271± 0.00030 resp~*ctively, which showed high haplotype diversity and low nueleotide diversity. Neutral test of Tajima's (-2.36010), starz-like statistical parsimony cladogram and mismatch distribution revealed a population expansion at about 80 thousand years in Miichthys miiuy. Low genetic differentiated index (Fst=-0.0190-0.0081) and high gene flow (Nm=-62.53-26.82), intertwined haplotypes of various geographie populations in Neighbor-joining and TCS tree, and analysis of molecular variance (AMOVA, -1.12%) among populations showed no significant population differentiation,and the three populations could be protected as a single management unit, which wereI inconsistent with conventional partitions of geographical population. A eertern degree of migration in the life history and insufficient time to attain a equilibrium "after a large range population expansion may be attributed to account for the lack of genet/c structure .

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995