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珍稀植物杨叶肖槿ISSR体系建立及检测
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]深圳大学生命科学学院,广东深圳518060, [2]深圳市绿化管理处,广东深圳518029
  • 相关基金:国家水体污染控制与治理科技重大专项(2008zx07526);广东省科技项目([2009]198);深圳市科技项目(SY200806270107A);深圳市城管局项目(OTCl018212,201009,2010015)
中文摘要:

针对珍稀植物杨叶肖槿ISSR反应的特点,建立了适用于杨叶肖槿遗传多样性研究的ISSR最适反应体系,具体包括:2.0,uL10×Buffer,27.5ng的摸板DNA,2.0uL的dNTP,1U的Pyrobest DNA酶,1.25umol/L的引物;最佳反应程序为94°C预变性5min,然后94°C变性1 min,49°C退火45s,72°C延伸1 min,35个循环;最后72°C延伸10 min,4°C终止反应。应用该优化的反应体系筛选出了10条稳定性强、清晰度高而且表现出一定多态性的ISSR引物,并对杨叶肖槿进行了检测,获得了清晰稳定的扩增图谱。

英文摘要:

To seek a standardizing program of ISSR technique for genetic diversity analysis of Thespesia populnea ,a single factor experiment was designed to optimize ISSR PCR amplification system. The suitable reaction system was obtained,that is 20uL reaction system containing 2.0 uL of 10XBuffer,27.5 ng of to- tal DNA, 2.0 uL of dNTP , 1 U Pyrobest DNA polymerase and 1.25 umol/L of ISSR primer. The profile of ISSR-PCR was an initial denaturation step for 5 min at 94°C ,follow by 35 cycles of 1 min at 94°C ,45 s at annealing temperature 49°C ,1 min at 72°C ,and a final elongation 10 min at 72°C for one cycle,then termi- nation reaction at 4°C . Ten polymorphic primers were screened using this reaction system. Stable and clear amplification patterns were obtained, indicating the ISSR-PCR amplification system was feasible. The fac- tors affecting the amplification of genome DNA of Thespesia populnea were also discussed in the paper. It provides the basis on studies of germplasm resources and genetic diversity of T. populnea.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104