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甘蓝自交不亲和相关转录因子BosiPA1蛋白基因的克隆与表达分析
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:《园艺学报》
  • 时间:0
  • 分类:S635[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]西南大学园艺园林学院,南方山地园艺学教育部重点实验室,重庆400716, [2]西南大学农学与生物科技学院,重庆400716
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30900986);重庆市自然科学基金项目(2009BB1298);西南大学博士基金项目(SWUB2008042)中央高校基本科研业务费专项资金项目(XDJK20108010,XDJK2009C126)
中文摘要:

通过自交不亲和甘蓝‘A1’自花授粉1 h 和未授粉柱头蛋白质表达谱的对比,鉴定出1 个受 自花授粉诱导上调表达的蛋白,通过PCR 技术获取了其编码序列,命名为BosiPA1 蛋白,其基因全长为 3 730 bp,具有1 个1 092 bp 的完整编码框(KF314579)。BosiPA1 由6 个外显子、5 个内含子组成,编码 363 个氨基酸。序列分析表明BosiPA1 蛋白具有典型的basic helix-loop-helix(bHLH)功能域,在SCR、SRK、 Exo70A1 基因的ATG 上游启动子序列中存在可以被bHLH 功能区识别并结合的E-box(CANNTG)序列。 在分子进化上甘蓝BosiPA1与AtbHLH128 距离最近,与AtHEC1/2/3 和TgGBOF-1 处在同一个分支。RT-PCR 检测表明甘蓝BosiPA1 基因在花瓣、萼片、花粉、柱头和叶片中均有表达;荧光定量PCR 分析表明BosiPA1 基因在自花授粉10 min、30 min、1 h 的柱头中呈逐渐上升趋势。上述结果说明BosiPA1 与bHLH 的进化 分支较早,可能是一个参与甘蓝多器官发育的自交不亲和相关的转录因子。

英文摘要:

Through the contrast of the stigma protein expression profiling between after self-pollination and none-pollination of Brasscia oleracea L. SI line A1,an up-regulated protein was identified,which was named BosiPA1 protein. The full-length DNA of this gene was 3 730 bp,and the ORF(open reading frame)was 1 092 bp. The gene contained six exons and five introns,encoded 363 amino acids,the amino acids sequence analysis showed that BosiPA1 contained a typical basic helix-loop-helix(bHLH)domains,which can recognize and bound the E-box(CANNTG)sequence. There are the E-box sequence in the promotersequences upstream of the ATG of SCR,SRK,Exo70A1. Phylogenetic tree analysis showed that Brassica oleracea L. BosiPA1 was most close to AtbHLH128,and grouped into one clade with AtHEC1/2/3 and TgGBOF-1. RT-PCR analysis indicated that BosiPA1 was expressed in petal,sepal,pollen,stigma and leaf,the further real-time fluorescence quantitative PCR analysis showed that the relative expression level of BosiPA1 in the stigma increased continually after 10 min,30 min,1 h self-pollination. All the results indicated that BosiPA1 may be a transcription factor related with SI and involved in multi-organs development in Brasscia oleracea L.

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期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371