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结球甘蓝AUX/IAA家族基因BoIAA2与BoIAA19的克隆与表达分析
  • ISSN号:1008-0864
  • 期刊名称:《中国农业科技导报》
  • 时间:0
  • 分类:S635.1[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]南充市农业科学院蔬菜研究所,四川南充637000, [2]西南大学园艺园林学院,重庆400716
  • 相关基金:973计划项目(2012CB113900); 国家自然科学基金项目(30900986); 现代农业产业技术体系四川蔬菜创新团队专项资助
中文摘要:

为了探究AUX/IAA家族基因在结球甘蓝叶片与茎尖发育过程中的功能,筛选出对甘蓝叶片与茎尖发育具重要影响的相关AUX/IAA基因。试验以结球甘蓝品系"519"为材料,通过对莲座期叶片与茎尖,结球期叶片与茎尖的转录组比较分析,筛选出在两个组织中均表达差异显著的2个AUX/IAA基因,分别为BoIAA2与BoIAA19。采用PCR技术分别获得基因BoIAA2与BoIAA19的编码序列,其CDS(coding sequence)全长分别为519 bp、585 bp,编码172、194个氨基酸;进一步序列分析发现BoIAA2、BoIAA19分别与大白菜BrIAA2、油菜BnIAA19氨基酸同源相似性均达99%,且均具有AUX/IAA蛋白的DomainⅠ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ特异性结构域。利用荧光定量PCR分析表明BoIAA2和BoIAA19在叶片、茎尖中的表达量均呈现出结球期高于莲座期的变化趋势,与转录组分析结果相符;对其结合蛋白基因BoTIR1和BoARF8进行表达分析,结果显示二者与BoIAA2、BoIAA19在叶片、茎尖中不同时期的表达量变化趋势一致;由此,推测BoIAA2和BoIAA19可能通过与BoTIR1和BoARF8的结合影响生长素信号转导,进而调控结球甘蓝叶片及茎尖的生长发育。

英文摘要:

To explore the function of AUX/IAA family genes on leaves and shoot tips development in cabbage,and screen the key AUX/IAA genes associated with leaves and shoot tips development,this study took cabbage line‘519'as material and though transcriptome comparative analysis screened 2 AUX/IAA genes expressed significantly different in shoot and leaves tips during heading and rosette stages,named BoIAA2 and BoIAA19,respectively.The c DNA sequences of BoIAA2 and BoIAA19 gene were obtained by PCR.Their CDS length was 519 bp and 585 bp,and encoded 172,194 amino acids,respectively.Further sequences discovered that the comparability of BoIAA2 and BoIAA19 with BrIAA2 and BnIAA19 were 99%,which contained the typical AUX/IAA DomainⅠ,Ⅱ,Ⅲ and Ⅳ.The RT-PCR analysis showed that the relative expression levels of BoIAA2 and BoIAA19 genes during heading stage were higher than rosette stage both in leaves and shoot tips,which was completely consistent with expression trend of their binding protein genes BoTIR1 and BoARF8,suggesting that BoIAA2 and BoIAA19 might regulate auxin signaltransduction by combining backward genes BoTIR1 with BoARF8,and participate in leaves and shoot tips development regulation in cabbage.

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期刊信息
  • 《中国农业科技导报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:科学技术部
  • 主办单位:中国农村技术开发中心
  • 主编:范云六
  • 地址:北京市海淀区中关村南大街12号中国农业科学院生物技术研究所
  • 邮编:100081
  • 邮箱:nykjdb@163.com
  • 电话:010-82106118
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0864
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3900/S
  • 邮发代号:82-245
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12485