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鼠Ⅲ型肝炎病毒H-2K^K限制性CTL表位的初步鉴定
  • ISSN号:1000-8861
  • 期刊名称:《免疫学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R392.11[医药卫生—免疫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]重庆理工大学化学与生物工程学院分子设计实验室,400050, [2]第三军医大学新桥医院全军呼吸研究所,重庆400037, [3]全军肿瘤研究所, [4]第三军医大学基础部全军免疫学研究所,重庆400038
  • 相关基金:国家自然科学基金(30471579,30571714);新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-06-0780);全国优秀博士学位论文作者专项资金资助项目(200776)
中文摘要:

目的预测和初步鉴定鼠Ⅲ型肝炎病毒(MHV-3)的CTL表位,为基于慢性肝炎病毒抗原表位的免疫治疗奠定理论基础。方法利用超基序、量化基序及人工神经网络方案相结合预测MHV-3s蛋白的H-2K^K限制性CTL表位;用分子模拟对候选表位肽做进一步筛选;人工二合成相关待测表位肽,利用T2-K^K细胞株测定各肽与H-2K^K分子的结合力。结果结合超基序、量化基序、人工神经网络预测结果及分子模拟结果,预测出了4条候选表位肽。MHC亲和力实验表明,在候选的4条表位肽中,IEPYNGVI(141—148)、YELSGYTV(306—313)与H-2K^K呈中等亲和力结合,荧光系数分别为1.25及1.04。结论表位预测的结果与亲和力分析结果一致性较好,两者联合应用初步认为IEPYNGVI(141—148)及YELSGYTV(306—313)为MHV-3s蛋白H-2KK限制性CTL表位的可能性最大,为下一步体内鉴定及基于小鼠肝炎病毒抗原表位的免疫治疗奠定基础。

英文摘要:

Objective We identified H-2K^K-restricted CTL epitopes from mouse hepatitis virus strain 3, and the present study would benefit to the application of specific immunotherapy based on hepatitis virus derived epitope. Supermotif, quantitative motif combined with artificial neural network (ANN) and molecular modeling were used in the prediction of H-2K^K restricted cytotoxie T lymphocyte (CTL) epitope front amino acid sequence of mouse hepatitis virus strain 3. The predicted peptides were synthesized with solid phase strategies, purified with reverse phase HPLC, and finally identified with mass spectrometry; T2-K^K cell line was used to de- termine the peptide binding with H-2K^K molecule. At last, four candidate peptides were predicted by supermotif combined with quan- titative motif and ANN. Among the four predicted peptides, IEPYNGVI (141-148) and YELSGYTV (306-313) could bind to H-2K^K with moderately affinity, and the value of fluorescence index (FI) was 1.25 and 1.04, respectively. Our results suggested that epitope prediction with supermotif combined with quantitative motif and ANN was consistent with peptide binding assay. In this study, both epitope prediction and binding assay showed that IEPYNGVI (141-148) and YELSGYTV (306-313) may be the H-2K^K-restrieted epitopes from MHV-3.

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期刊信息
  • 《免疫学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:第三军医大学
  • 主办单位:第三军医大学 中国免疫学会
  • 主编:吴玉章
  • 地址:重庆市沙坪坝高滩岩
  • 邮编:400038
  • 邮箱:richard@mail.tmmu.com.cn
  • 电话:023-68752237
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8861
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1332/R
  • 邮发代号:78-32
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊三等奖,全军优秀医学期刊奖,重庆市优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13273