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DNA条形码技术在河北保定、廊坊地区鳞翅目昆虫上的应用及小型区域数据库的构建
  • ISSN号:2095-1353
  • 期刊名称:《应用昆虫学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q523[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]首都师范大学生命科学学院,北京100048, [2]东北林业大学哈尔滨150040
  • 相关基金:资助项目:国家自然科学基金项目(31272340,30700641);北京市人才强教项目(PHR201107120);中华人民共和国科学技术部科技基础性工作专项重点项目(2012FY110800);高等学校博士学科点专项科研基金(20101108120002)
中文摘要:

【目的】为了探究DNA条形码技术和小型区域数据库在蛾类鉴定上的可行性,本研究利用条形码通用引物扩增了采自河北保定、廊坊地区10种夜蛾82个样本的线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(MitochondrialcytochromeCoxidasesubunit Ⅰ,COⅠ)基因序列。【方法】基于进化树、距离、阈值和特征的方法。【结果】虽然整体分类效果较好,但基于进化树、距离、阈值的方法都无法将二点委夜蛾Athetislepigone进行较好的分类;样本LF110802.008总是被分入标瑙夜蛾Maliatthasignifera类群,与形态学分类结果发生分歧。基于特征的方法运用核基因28S进行分析,结果与形态分类一致。同时还探讨了基于特征方法得到的诊断特征数目与样本数量之间的关系,发现两者密切相关;基于特征的方法对小样本量的鉴定也比较有效。本研究建立了小型区域的DNA条形码数据库,使物种识别具有更强的针对性,有利于提高地区性蛾类病虫害防治效果。【结论】在蛾类鉴定中,DNA条形码有很好的分类效果,小型区域数据库很有实际应用价值。

英文摘要:

[Objectives] To explore the feasibility of DNA barcoding and establishing a local DNA barcoding library for the identification of moths, the CO Ⅰ genes of 82 samples from 10 Noctuidae species in Baoding and Langfang (Hebei Province) were amplified using universal barcoding primers. [Methods] Tree-based, distance-based, threshold-based and character-based methods. [Results] The results show that DNA-based classification was generally consistent with that of traditional methods. However, sample LFl10802.008 was misclassified as Maliattha signifera, which differs from the morphological results. Using character-based methods to analyze the 28S gene produced results were consistent with the morphological taxonomy. The effect of sample sizes on the number of diagnostic characters was investigated. Character-based methods are relatively effective, even in the case of small sample sizes. We propose the establishment of a local DNA barcoding library in order to make species identification is more effective. [ConcInsion] DNA barcoding produces good classification results and a local DNA barcoding library would be useful for moth identification.

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期刊信息
  • 《应用昆虫学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国昆虫学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:戈峰
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院5号中科院动物所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:entom@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807137
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-1353
  • 国内统一刊号:ISSN:11-6020/Q
  • 邮发代号:2-151
  • 获奖情况:
  • 96、2000年获中科院《优秀期刊三等奖》,92年获中国科协《优秀学术期刊一等奖》,2001进入“中国期刊”方阵,“双百”期刊,排名第96位
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:3170