中文摘要：

目的应用不同的分子标记进行柴胡药材干根遗传多样性分析，为柴胡栽培种鉴别和药材鉴别奠定基础。方法以柴胡栽培种干根为材料，采用RAPD和AFLP两种分析方法。结果以筛选到的3条随机引物对9个柴胡栽培种进行RAPD分析，共扩增出28条DNA带，平均每条引物组合扩增9．33条带，其中多态性带为6．67条，多态性比率为71．43％；而在AFLP分析中，筛选出4对特异性引物，共获得107条DNA带，平均每对引物扩增26．75条带，其中多态性带为23．25条，多态性比率为86．92％。经统计分析，9个柴胡栽培种RAPD和AFLP分析的Jaccard遗传相似系数分别介于0．61～0．93和0．39～0．86。UPGMA聚类分析，两种标记方法均可将9个柴胡栽培种聚为3大类群，聚类结果相似但不完全相同。结论以柴胡药材干根为材料，RAPD和AFLP两种分子标记均可用于植物种间及种下遗传关系分析，且AFLP条带较多，多样性丰富，更有利于柴胡属植物多样性的分析。