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nanoLC—ESI/MS/MS在ECV304细胞蛋白质组学研究中的应用
  • ISSN号:1000-4718
  • 期刊名称:《中国病理生理杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R589[医药卫生—内分泌;医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学] R285.5[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学]
  • 作者机构:[1]复旦大学上海医学院病理学系,上海200032, [2]南通大学医学院病理学教研室,江苏南通226001, [3]暨南大学组织移植与免疫中心,广东广州510632, [4]暨南大学医学院,广东广州510632
  • 相关基金:国家自然科学基金面上资助项目(No.30600587);暨南大学引进人才启动基金资助项目(No.51205066)
中文摘要:

目的:应用纳升液联用技术(nanoLC—ESI/MS/MS)对ECV304细胞蛋白质组学进行初步分析。方法:提取ECV30d细胞总蛋白,经变性、还原、烷基化和酶解,nanoLC—ESI/MS/MS对酶解后的肽段进行分析,数据库(Swissprot)检索鉴定蛋白质,生物信息学工具对所鉴定的蛋白质进行细胞定位和功能分类。结果:从8μg细胞总蛋白中鉴定了120种蛋白质,所鉴定蛋白质的分子质量(MW)范围从6648D至280739D,MW〈20kD的蛋白质占24.2%,MW〉100kD的蛋白质占5.0%;主要位于细胞质、细胞骨架、细胞核和细胞膜,分别为27.8%、19.0%、15.2%和10.1%;大多为结构蛋白质和催化活性的蛋白质,分别为36.4%和34.1%,具有信号转导活性的占11.4%;其中角蛋白8、18和vimentin等为内皮细胞特异表达的蛋白质。结论:本研究建立了nanoLC—ESI/MS/MS分析ECV304细胞的蛋白质组学方法,为内皮细胞及内皮细胞损伤机制的蛋白质组学研究奠定了实验基础。

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期刊信息
  • 《中国病理生理杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国病理生理学会
  • 主编:陆大祥
  • 地址:广东省广州市黄埔大道西601号
  • 邮编:510632
  • 邮箱:obsbjbb@jnu.edu.cn
  • 电话:020-85220269
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4718
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1187/R
  • 邮发代号:46-98
  • 获奖情况:
  • 1997-2000年连续获得中国科协优秀基础性和高科技...,1992、1996、2000、2004、2008年,连续五次入选中...,2008-2010年,连续三年荣获“百种中国杰出学术期...,2010年获广东省期刊最高奖——品牌期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:37010