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猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)江苏分离株NJGC ORF5基因的克隆及遗传变异分析
  • ISSN号:1000-4440
  • 期刊名称:江苏农业学报
  • 时间:2011
  • 页码:775-781
  • 分类:S855.3[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]江苏省农业科学院兽医研究所,农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,国家兽用生物制品工程技术研究中心,江苏南京210014
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31001066); 江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(09)619]; 国家农业公益性行业专项(200803020)
  • 相关项目:猪肺炎支原体和猪繁殖与呼吸综合征病毒混合感染的分子机制研究
中文摘要:

为了分析江苏省流行的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传变异特征,采用RT-PCR方法对江苏地区分离的PRRSV NJGC株的ORF5基因进行了克隆和测序,利用DNAstar软件与国内外代表性毒株进行了同源性分析与序列对比,并绘制了系统进化树。结果表明:NJGC株属于美洲型PRRSV,其ORF5基因与美洲型代表毒株VR-2332的同源性为90.5%,与中国的经典毒株CH-1a的同源性为92.5%,与中国高致病性PRRSV毒株的同源性在98.0%以上;进化树分析结果显示,NJGC株和高致病性PRRSV在同一进化分支,推测其属于高致病性PRRSV,且与2006年分离的SY0608有更近的亲缘关系,体现了PRRSV具有一定的地域性。同时,该基因编码蛋白的抗原表位和抗原性也发生了变化。依据序列推断PRRSV NJGC株属于具有明显地域性的高致病性PRRSV。

英文摘要:

To analyze the genetic variation of porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) in Jiangsu Province,the ORF5 genes of PRRSV strain NJGC were amplified,cloned and sequenced by RT-PCR,and blasted with the representative isolates using DNAstar software.The results showed that PRRSV isolate NJGC belonged to the North American genotype.The ORF5 gene of strain NJGC shared 90.5% sequence similarity with the North American prototype VR-2332,92.5% similarity with CH-1a,the first PRRSV isolate in mainland China in 1996,and over 98.0% similarity with the highly pathogenic PRRSV.The phylogenetic tree indicated that the PRRSV NJGC possed a same branch with the highly pathogenic PRRSV,and shared a closer relationship with the SY0608.The typical geographic genetic relationship existed in the Jiangsu strain of PRRSV.Meanwhile,there are changes in the epitopes and the antigenicity of ORF5 encoded protein.

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期刊信息
  • 《江苏农业学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江苏省农业科学院
  • 主办单位:江苏省农业科学院
  • 主编:严少华
  • 地址:南京市孝陵卫省农科院经信所
  • 邮编:210014
  • 邮箱:jsnyxb@163.com
  • 电话:025-84390285
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4440
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1213/S
  • 邮发代号:28-113
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊,江苏省优秀科技期刊,中国中文核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,2008年获“江苏省质量评估”一级期刊20069年获...
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15981