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美国红鱼和大黄鱼β-珠蛋白基因的克隆和遗传进化分析
  • ISSN号:0517-6611
  • 期刊名称:《安徽农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院亚热带农业生态研究所,湖南长沙410125, [2]浙江大学生物医学与仪器工程学院,浙江杭州310027
  • 相关基金:中国科学院海外杰出学者基金项目(2005-14,1-7);国家973项目(2004CB117502);国家自然科学基金项目(30671517,30528006).
中文摘要:

根据已发表的其他脊椎动物β-珠蛋白基因序列设计并合成1对特异性引物,通过RT-PCR方法首次克隆到美国红鱼和大黄鱼β-珠蛋白cDNA,其开放读码框均由447个碱基组成,编码148个氨基酸的多肽,预测的相对分子量分别为16333和16148Da,两者核苷酸序列和推导的氨基酸序列同源性分别为90.4%与81.2%。将推导的美国红鱼和大黄鱼β-珠蛋白氨基酸序列与其他鱼类及人β-珠蛋白氨基酸序列进行同源性比较,其同源性在35.5%~70.3%,它们与同属真口鱼纲的真鲷、黄尾鲱鱼、鲤鱼、虹鳟等的同源性较高,而与肉鳍鱼纲的肺鱼及板鳃纲的鲨鱼的同源性较低;二级结构预测表明,美国红鱼和大黄鱼β-珠蛋白存在类似哺乳动物的8个α-螺旋区,在近端与远端与血红素结合的组氨酸高度保守。

英文摘要:

The β-globin gene and amino acid sequence of large yellow croaker ( Pseudosciaena crocea ) and red drum( Sciaenops ocellatus )were first described. The entire open reading frames of two β-gjobin genes were beth 447 bp long and codified 148 amino acid residues, The homology between them was 90.4 % for nucleotides and 81.2 % for deduced amino acids.Amino acid identity of two β-globin genes compared with those reported in other vertebrates including shark, teleosts and human, ranged from 35.5 to 70,3 %, The proximal histidine residues at the heme binding region and the important functional residues that were involved in the contacts with the heme and between interfaces were conserved.

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期刊信息
  • 《安徽农业科学》
  • 北大核心期刊(2008版)
  • 主管单位:安徽省农业科学院
  • 主办单位:安徽省农业科学院
  • 主编:曹淑华
  • 地址:合肥市庐阳区农科南路40号
  • 邮编:230031
  • 邮箱:ahnykx@163.com
  • 电话:0551-65148869 65160973
  • 国际标准刊号:ISSN:0517-6611
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1076/S
  • 邮发代号:26-20
  • 获奖情况:
  • 1995年获安徽省优秀期刊三等奖,1998年获安徽省优秀期刊三等奖,2002年获第三届全国优秀农业期刊奖,2005年获第四届全国优秀农业期刊一等奖,2005年获安徽省优秀科技期刊一等奖,2006年获第五届全国农业期刊金犁奖学术类一等奖,第四届华东地区优秀期刊,2009年安徽省优秀期刊,RCCSE中国权威学术期刊(A+),中国农业核心期刊(2010)
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版)
  • 被引量:163721