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茎瘤芥光敏色素PHYB基因片段的克隆与序列分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S637.3[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]重庆大学基因工程研究中心,重庆400030, [2]重庆邮电大学生物信息学院,重庆400065, [3]河南大学生命科学学院,棉花生物学国家重点实验室,河南开封475001
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31071461):重庆市科技攻关项目(CSTC,2011AB1095);重庆市自然科学基金项目(CSTC,2011AB1095);重庆市教委科学技术研究项目(CSTC,KJ130510,KJ110506,KJ130509,KJ130502)
中文摘要:

以茎瘤芥(Brassica juncea var. tumida Tsen et Lee)‘永安’为材料,通过 RACE 和 RT-PCR技术得到 1 个 AP2/EREBP 转录因子基因的 cDNA 全长序列和基因组 DNA(gDNA)序列,该基因与拟南芥AtABR1基因的氨基酸序列相似性高达72%,因此命名为BjABR(1GenBank登录号:JQ713825.1)。BjABR1基因 gDNA 序列含 1 个内含子;cDNA 序列全长 1 514 bp,含有 1 个 1 146 bp 的开放阅读框(ORF),编码 381 个氨基酸;其推定编码的蛋白分子量为 41.674 kD,等电点为 9.11,具有 14 个磷酸化位点,含 1个典型的 AP2 DNA 结合域和 1 个 CMX-1 基序。洋葱表皮细胞的瞬时表达显示,BjABR1 蛋白定位于细胞核。荧光定量 PCR 分析结果表明,该基因在茎瘤芥不同发育时期的根、茎、叶中均有表达,但在根中表达量极高;在对茎瘤芥组培幼苗进行高盐、渗透压和低温 3 种非生物胁迫处理后发现,3 种胁迫均能诱导该基因表达,但其对高盐的响应更为迅速。

英文摘要:

The full length eDNA sequence and genomic DNA (gDNA) sequence of an AP2/EREBP transcription factor family gene were cloned from Brassicajuncea var. tumida Tsen et Lee 'Yong'an' by RACE (rapid amplification of cDNA ends) and RT-PCR. Amino acid sequence alignment showed the gene shared 72% similarity with a known Arabidopsis thaliana AP2/EREBP family gene, AtABR1, named after BjABR1 (GenBank accession No. JQ713825.1 ). BjABR1 gene contained one intron and putatively encoded 381 amino acids with the protein molecular mass of 41.674 kD, the pI of9.11, 14 phosphorylation sites and an AP2 DNA-bind domain and a CMX-1 motif. Subcellular localization assays showed that theBjABR1 protein appeared in the nucleus. Quantitative real-time PCR analysis revealed that BjABR1 gene was expressed in root, stem and leaf, and highest in the root. The expression of BjABR1 was inducible under salt stress, osmotic stress and cold stress, and its transcriptional responses subject to salinity was most sensitive.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995