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鸭瘟病毒dUTPase基因的分子特性及转录时相分析
  • ISSN号:1002-0470
  • 期刊名称:《高技术通讯》
  • 时间:0
  • 分类:Q943.2[生物学—植物学] S858.325.3[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心,雅安625014, [2]动物疫病与人类健康四川省重点实验室,雅安625014, [3]四川大学分析测试中心,成都610064, [4]广东温氏食品集团有限公司温氏研究院,新兴527400
  • 相关基金:国家自然科学基金(30771598)、教育部“新世纪优秀人才支持计划”项目(NCET-04-0906/NCET-06-0818)、国家“十一五”科技支撑计划(2007Z06-017)、高等学校科技创新工程重大项目培育资金项目(706050)资助.
中文摘要:

应用大量生物信息学分析工具及RNA斑点杂交技术对本实验室构建鸭瘟病毒(Duck plague virus,DPV)CHv株基团文库时新发现的dUTPase基因(GenBank(登录号DQ486149)进行了分子特性及转录时相分析。研究表明:该基因大小为1344bp,编码447个氨基酸,包含dUTPase家族蛋白的5个保守motifs,排列形式3-1-2-4—5具备Ⅱ型dUTPELse的典型特征。DPV CHv dUTPase基因在25个疱疹病毒参考株之间高度保守,并与α疱疹病毒的氨基酸同源性较之与β、γ疱疹病毒要高。DPV CHv dUTPase基因转录检测发现DPV感染宿主细胞后最早30min可检测到该基因转录产物,随后转录产物量迅速放大.4h达高峰,24h后下降至相对低的水平。该研究为阐明病毒基因表达调控机理提供了有用的实验数据,并对病毒其他基因的发现和研究具有指导性意义。

英文摘要:

A large number of bioinformatics analysis tools and the RNA dot-blot the features of the DPV CHv dUTPase gene (GenBank accession number hybridization technique DQ486149), which was were used to identify first discovered when constructing the duck plauge virus (DPV) CHv strain library in our laboratory. The study shows that the DPV CHv dUTPase gene consists of 1344 nucleotides encoding for a polypeptide of 447 amino acid residues. Moreover, the dUTPase of DPV CHv has five conserved motifs as that among dUTPase family proteins, and the arrangement according to 3-1-2-4-5 belongs to the Class Ⅱ dUTPase subfamily. The sequence comparison of dUTPase among DPV CHv and 25 other reference herpesvirus strains show that DPV CHv is more homologous to alphaberpesviruses than to betaherpesviruses or gammaherpesvimses. The transcription analysis of DPV CHv dUTPase gene shows that the transcripts can be firstly detected at 30 minutes after infection, and then the accumulation reaches a peak in 4 hours. Twenty-four hours later, the transcripts descend significantly to a relatively low level. In a word, these experimental results provide valuable experimental data and certain significance for clarifying the expression regulation of virus genes.

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期刊信息
  • 《高技术通讯》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国科学科技部
  • 主办单位:中国科学技术信息研究所
  • 主编:赵志耘
  • 地址:北京市三里河路54号
  • 邮编:100045
  • 邮箱:hitech@istic.ac.cn
  • 电话:010-68514060 68598272
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-0470
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2770/N
  • 邮发代号:82-516
  • 获奖情况:
  • 《中国科学引文数据》刊源,《中国科技论文统计与分析》刊源
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘
  • 被引量:12178