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鹅细小病毒CHv强毒株VP3基因克隆及遗传进化
  • ISSN号:1672-6871
  • 期刊名称:《河南科技大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]河南科技大学功能微生物与免疫重点实验室,河南洛阳471003, [2]动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014, [3]河南省宜阳县种子管理站,河南宜阳471600
  • 相关基金:教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET20420906);教育部高等学校科技创新工程重大项目(706050)
中文摘要:

根据Genbank中的鹅细小病毒(GPV)B株全基因序列,设计合成一对引物,应用PCR技术扩增了GPV强毒株CHv的VP3基因片段,将扩增后的VP3基因重组到pMD18-T质粒载体上,并对插入片段进行序列测定,将测序结果及由该结果推导的氨基酸序列与国内外分离的GPV、MDPV、PPV和CPV等不同宿主的细小病毒的VP3进行比对分析。结果表明:中国四川分离的GPV CHv株VP3基因长1 605 bp,编码534个氨基酸,与国内外10株GPV的VP3基因进行比较,核苷酸同源性为93.4%~99.8%,氨基酸同源性为96.5%~99.3%,其变异较小,是GPV保持一个血清型的分子基础。与番鸭细小病毒的核苷酸和氨基酸同源性分别为79.6%和89.9%,而与其他种属的细小病毒同源性均在30%以下,表明它们与GPV CHv株亲缘关系较远。

英文摘要:

Primers were designed according to the genome of GPV B strain in Genbank.The DNA encoding VP3 structure protein of GPV CHv strain was amplified by PCR.The VP3 gene was cloned into pMD18-T vector and then sequenced.The DNA and amino acid sequence were compared with other GPV,MDPV,PPV,CPV and BPV.The results showed that the DNA of VP3 was 1 605 nt and coding 534 amid acids,shared 93.4%~99.8% nucleotide sequences identity with those published in Genbank,and shared 96.5%~99.3% amino acid sequence identity,which was the reasons that there was only one serum type of GPV.GPV CHv VP3 and MDPV shared 79.6% nucleotide sequences identity and 89.9% amino acid sequence identity,and shared less 30% nucleotide sequences identity with other parvovirus.

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期刊信息
  • 《河南科技大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河南省教育厅
  • 主办单位:河南科技大学
  • 主编:苏娟华
  • 地址:河南省洛阳市开元大道263号
  • 邮编:471023
  • 邮箱:hkdxbz@haust.edu.cn
  • 电话:0379-64231476
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-6871
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1362/N
  • 邮发代号:36-285
  • 获奖情况:
  • 1999年全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技...,全国高校自然科学优秀学报,河南省优秀科技期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4775