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利用亚细胞位置特异的基因功能模块与表达调控网络识别疾病特征基因
  • ISSN号：0023-074X
  • 期刊名称：《科学通报》
  • 时间：0
  • 分类：Q756[生物学—分子生物学] TP336.03[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构：[1]哈尔滨医科大学生物信息学系,哈尔滨 150086, [2]同济大学生命科学与技术学院,上海 200092, [3]Departments of Molecular Cardiology and Cardiovascular Medicine,the Cleveland Clinic Foundation,9500 Euclid Avenue,Cleveland,Ohio 44195,USA
  • 相关基金：本工作为国家自然科学基金（批准号：30170515,30370388,30370798,30570424和30571034）、国家重点基础研究发展计划（批准号：2003AA2Z2051和2002AA2Z2052）、黑龙江科技攻关重点（批准号：GB03C602-4）、哈尔滨市科技攻关（批准号：2003AA3CS113）、黑龙江自然科学基金（批准号：F0177）和黑龙江省教育厅杰出海外学人基金（批准号：1055HG009）资助项目.
作者： 张敏[1], 朱晶[1], 郭政[1,2], 李霞[1,2], 杨达[1], 王磊[1], 饶绍奇[1,3]
关键词： 基因表达谱, Gene, ONTOLOGY, 功能模块, 特征基因, 基因调控网络
中文摘要：

利用Gene Ontology中的生物过程（biological process）及细胞组分（cellular component）两种分类体系,选择显著聚集差异表达基因的复合功能模块,识别其中能够有效分类疾病样本的特征功能模块,以特征功能模块中的差异表达基因作为特征并分析它们与疾病的相关性.对前列腺癌、胃癌和白血病数据的分析结果表明,基于特征功能模块的特征基因选择方法可以识别与疾病高度相关的功能一致的特征基因.进一步的分析显示,根据特征功能模块和基因表达调控信息构建基因表达调控网络,可以从中挖掘可能的疾病关键特征基因,并提示对复杂疾病同时应答的多功能模块间协同作用关系机理研究的重要线索.同时,本研究结合基因功能分类的疾病特征基因选择方法提示了一种高准确度的疾病分类方法,分类结果有明确的生物学意义,对复杂疾病的分子病理学研究亦有重要的意义.

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期刊信息
  • 《科学通报》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院
  • 主编：周光召
  • 地址：北京东黄城根北街16号
  • 邮编：100717
  • 邮箱：csb@scichina.org
  • 电话：010-64036120 64012686
  • 国际标准刊号：ISSN：0023-074X
  • 国内统一刊号：ISSN：11-1784/N
  • 邮发代号:80-213
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘（网络版）,美国数学评论（网络版）,美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:81792