现阶段日本的水利管理制度在沿袭土地改良区的历史演变模式中,对区域内所属的农田水利进行了资金保证、组织机制、法制健全、产权清晰等兼有的农民自治管理模式,得到了非常好的效果。本文详细分析了日本水土兼管的缘由及土地改良区在当代农民自治中的地位及影响,并对农民自治水利管理模式进行了分析与评价,结合我国国情,提出了以法律保障、利益补偿、市场化经营为引导的中国农民自治水利管理模式。