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安徽长江水系黄鳝的群体遗传结构分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S917.4[农业科学—水产科学] Q347[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]安徽省农科院水产研究所,安徽合肥230031
  • 相关基金:国家公益性行业(农业)科研专项(201003076); 安徽省农科院院长青年创新基金(13B0529); 安徽省农科院黄鳝创新团队(12c0501); 安徽省科技攻关项目(12010302056)
中文摘要:

为研究安徽长江水系黄鳝(Monopterus albus)的遗传多样性和群体遗传结构,测定了其6个地理群体(当涂、无为、繁昌、贵池、怀宁和望江)共178尾个体的线粒体DNA控制区部分序列。对其长度为556~558 bp的控制区同源序列进行分析,共检测到变异位点41个(变异率7.35%),单倍型56种。平均单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.694~0.954、0.00237~0.01382。群体分化指数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.01974~0.87529、0.07124~24.82928,分子变异分析(AMOVA)中,群体间遗传变异占61.72%,表明黄鳝群体间具有明显的遗传分化。基于单倍型或群体间遗传距离的分子系统进化树均显示,6个地理群体分为两支:当涂与繁昌群体聚为一支,其余4群体聚为另一支。

英文摘要:

To assess the genetic diversity and population structure of Monopterus albus, 178 individuals of 6populations(DT, WW, FC, GC, HN, WJ) from Anhui reaches in the Yangtze River were investigated based on 556-558 bp nucleotide sequences of mt DNA partial control region. The sequences analysis results showed that 41 variable sites(mutation rates of 7.35%), 56 haplotypes were detected. The haplotype diversity(Hd) and nucleotide diversity(Pi) were0.694-0.954 and 0.00237-0.01382, respectively. Analysis of molecular variance(AMOVA) revealed that genetic variation among the populations was 61.72%. These results indicated that there were significant genetic differentiations among populations. NJ-tree based on haplotypes or genetic distances among populations showed that DT and FC populations were clustered as one, and other 4 population was as another independent cluster.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995