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基于宿主基因组HBV整合位点分析寻找新的肝癌相关基因
  • 项目名称:基于宿主基因组HBV整合位点分析寻找新的肝癌相关基因
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81372679
  • 申请代码:H1617
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2014-01-01-2014-12-31
  • 项目负责人:吕全军
  • 依托单位:郑州大学
  • 批准年度:2013
中文摘要:

病毒整合被认为乙肝病毒(HBV)感染致癌密切相关,但确切机制尚未完全阐明。我们最近建立了较大规模的HBV整合信息数据集。通过对该数据集中整合病毒片段的序列在断点分布、突变及所携带的病毒调控元件等方面的分析,未见癌和癌旁组织存在差异;但对该数据集宿主序列的生物信息学分析发现,肝癌组织中潜在受HBV整合影响的宿主基因所参与的生物学过程和信号通路与癌旁组织存在显著差异,且肝癌组织中较为常见的整合位点所涉及的宿主基因如hTERT、MLL4、CCNE1等基因的功能均与肿瘤发生密切相关。我们推测受整合影响的宿主基因的功能和生物学特性在HBV整合致癌中具有重要作用,那些在不同肝癌组织重复发生的HBV整合位点附近的宿主基因可能具有一定的肿瘤相关性。本研究将对前期工作中获得的重复整合基因TUFT1和UBXN8进行深入的功能研究,并通过分析其在原发性肝癌样本中的表达和功能异常,确定其与肝癌发生的相关性及临床意义。

结论摘要:

英文主题词Hepatitis B virus;Hepatocellular carcinoma;HBV integration;recurrently targeted genes;UBXN8


成果综合统计
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