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基于探针杂交机制的生物芯片数据预处理统计方法研究
  • 项目名称：基于探针杂交机制的生物芯片数据预处理统计方法研究
  • 项目类别：面上项目
  • 批准号：10871009
  • 申请代码：A011403
  • 项目来源：国家自然科学基金
  • 研究期限：2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人：邓明华
  • 负责人职称：教授
  • 依托单位：北京大学
  • 批准年度：2008
中文摘要：

本项目研究跨实验室、跨平台芯片数据预处理与整合问题。旨在发展一套基于芯片探针杂交物理模型的统计方法，考虑到芯片中探针强度对探针序列的相关性以及PCR 扩增所带来的系统偏差，利用单芯片样本估计靶序列拷贝数，实现跨实验室、跨平台芯片数据标准化与整合。作为应用，拟将算法应用于多种芯片数据分析之中，分析包括基因表达芯片、SNP 芯片、Tiling Array 芯片以及外显子芯片(Exon Array)等流行的生物芯片数据，开发多种芯片数据预处理开源软件，为生物学家提供分析工具。

中文主题词： 基因芯片, PDNN 模型, 芯片探针, 靶序列拷贝数
结论摘要：

英文主题词Gene Chip, PDNN model, probe set, Copy number of target sequence

成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 11
  • 7
  • 0
  • 0
  • 0
期刊论文
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会议论文
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