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前列腺癌候选基因MSMB转录调控区变异及其功能机制研究
  • 项目名称:前列腺癌候选基因MSMB转录调控区变异及其功能机制研究
  • 项目类别:专项基金项目
  • 批准号:81241082
  • 申请代码:H1619
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:王建业
  • 负责人职称:主任医师
  • 依托单位:卫生部北京医院
  • 批准年度:2012
中文摘要:

前列腺癌(PC)早期诊断困难,然目前尚无特异性PC诊断生物标记物。本组在前期工作的基础上发现β微球精蛋白(MSMB)转录调控区存在PC关联的常见变异,提出这些变异可能影响了MSMB调控区的转录活性,从而改变了MSMB表达的工作假设。为此,本项申请拟首先对发现变异的MSMB基因组及其连锁区域进行全测序,并经大样本验证研究和比较鉴别等统计遗传分析,证实发现的PC关联变异。然后,通过荧光素酶报告基因、免疫共沉淀-蛋白质谱、EMSA、super-EMSA以及ChIP等多种分子生物学实验来证明关联变异的功能机理,最后经PC患者的肿瘤免疫组织化学检测验证,以及血清学的MSMB表达水平与PC的关系,展开研究这些变异的功能机制,并初步评价功能性变异作为潜在分子标记物的作用。研究结果可能为MSMB是否是PC的一个易感基因提供支持性证据,同时也可能为临床应用提供依据。

结论摘要:

PC(prostate cancer, PC)是我国老年男性中常见的恶性肿瘤之一。人β-微球精蛋白基因(microseminoprotein beta, MSMB)定位于人类10号常染色体,其编码精浆蛋白(prostatic secretory protein, PRPS)。近来逐渐增多的研究证据显示MSMB在PC患者的PC组织中呈低表达,并且MSMB在PC组织中的表达程度与复发率成负相关1-2。然而,与癌旁组织比较,MSMB在PC中低表达的原因仍然不清楚。以此,我们提出假设MSMB调控区变异可能影响了MSMB的转录。为了回答我们提出的假设,发现MSMB调控区上潜在的PC病因学变异,本项开展了以下两方面实验1)在转录水平检测24 对PC及其癌旁组织中MSMB的表达,筛选出在癌组织中MSMB显著低表达的(≤3倍)样本对。2)利用下一代高通量测序技术筛查这些样本对MSMB基因及其上游80Kb的基因组连锁区域。3)分析影响MSMB差异表达的单核苷酸变异(single nuclear variants,SNVs)。结果1)24对PC及其癌旁组织中,有19对显示MSMB在PC中的表达低于癌旁组织,其中9对呈显著性低表达。2)靶向测序结果共识别165个SNVs,其中69个为已经报道的常见SNVs,96个为新发现的SNVs。96个变异中27个位于MSMB的上游基因组序列, 68个位于intron序列,1个位于AL450342基因的编码区。96个新发现先的SNVs中,经生殖系传递的SNVs有37个,均为A/G的变异,变异频率在10%-60%;PC特异性的体细胞变异共42个,40个为A/G变异,2个位T/C变异。42个体细胞的变异频率在10%-30%。MSMB上游5Kb的序列中,频率为30%的体细胞变异有2个,频率为20%的体细胞变异有5个。这7个变异位点被78%(7/9)的PC肿瘤所携带。165个SNVs中共有11个变异位于CG位点上,它们均为生殖细胞变异。9对样品的测序结果中均未发现MSMB的3'UTR序列上有变异位点。结论本研究在MSMB的转录调控区初步发现7个新的高频体细胞SNVs,它们可能参与PC组织中MSMB的转录调节。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 27
  • 1
  • 0
  • 0
  • 0
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