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在基因组水平上探索核仁小分子RNA及其组织结构的演化
  • 项目名称:在基因组水平上探索核仁小分子RNA及其组织结构的演化
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30771214
  • 申请代码:C060501
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2008-01-01-2010-12-31
  • 项目负责人:谢君
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:复旦大学
  • 批准年度:2007
中文摘要:

项目"在基因组水平上探索核仁小分子RNA及其组织结构的演化"执行三年以来,基本完成了预期的任务。我们不但对核仁小分子(snoRNAs)和核小体分子(scaRNAs,与snoRNAs同源的但位置不同的一类小分子)进行文献检索,公共数据库搜索,数据提取,整理归类和综合分析,并整合入数据库snoRNAbase。目前我们的数据库snoRNAbase每天的国内外访问量达300多人次,关于该数据库的文章引用达15次,其中影响因子超过5的杂志文章(总引用达232次)引用达12次,是这一领域最全面和权威的数据库。在sno/scaRNAs及其组织结构的演化分析中,我们整合了snoRNA基因的不同特征来综合分析它们的演化事件。发现snoRNA基因进化的复杂性和多样性,以及snoRNA基因偏中性的特殊进化现象。同时我们发现了一些新的snoRNA基因和snoRNA簇从,并对它们特征进行了分析。另外我们花费了大量的精力和时间来研究复杂多变小分子的进化方法学问题,得到了研究这种问题的一系列的方法。为我们继续该类小分子以及类似问题提供了宝贵经验。

结论摘要:

英文主题词snoRNA; scaRNA; database;genome; evolution


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
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  • 著作
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  • 1
  • 0
  • 0
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