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基于表观遗传修饰研究正常-患病双生子证候差异机制
  • 项目名称:基于表观遗传修饰研究正常-患病双生子证候差异机制
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81072727
  • 申请代码:H2703
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:张天娥
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:成都中医药大学
  • 批准年度:2010
中文摘要:

执行前期基金项目发现,同卵双生子具患病一致性而非同步性特点,为探求双生子间差异本质,基于结构与功能相关性设计,以全基因组表达谱芯片和单核甘酸多态(SNP)芯片为核心技术,考察基因表达(功能)与SNP分布(结构),发现对内证候差异越大,差异表达基因越多,而对内SNP没有显著的差异,对基因表达不构成影响。在寻找答案过程中认识到,表型证候不一致的同卵双生子是研究疾病表观遗传机制最合适对象,通过基因修饰状态探寻其表达状态,有可能揭示同卵双生子证候差异机制。本计划拟以前期正常-患病双生子为对象,从4各层次(1.整体证候2.甲基化相关酶3.全基因组甲基化水平4.甲基化特异位点广泛性),以全基因组CpG岛芯片和MS-HRM为关键技术、生物信息融合为最终手段,探讨正常-脑瘫肾虚双生子证候差异,并与前期表达谱结果比对,获取脑瘫肾虚证全基因组甲基化特征谱式,筛选脑瘫表观标志分子,为脑瘫的早期诊断打下基础。

结论摘要:

在前期基金研究的基础上,本课题对正常-病证双生子全基因组DNA进行了甲基化芯片检测,并对其印记基因表达是否存在差异进行了筛选,获得了一系列有意义的结果①正常-病证双生对间证候差异越大,差异表达基因越多,但由甲基化调控引发的差异表达占12%左右;②通过对甲基化调控基因的生物信息分析,获取了与病证密切相关的甲基化调控基因群;③同时课题组认为其它如来自组蛋白修饰等的表观调控,值得今后进一步研究;④利用数据库比对,发现双生对间印记基因存在差异表达,其差异印记基因的多少随双生对年龄、病证复杂程度增加,候选了与脑瘫、糖尿病等复杂病症特征密切相关的印记基因组。 基金资助下,调查分析了来自宜宾市、彭州市和什邡市三地收集到的新生儿31423例,获取了478对双生子,其中宜宾、彭州、什邡三地双生子出生率分别为1.78%、1.35%、1.29%,在我国双生子出生率1-2%之间的范围,基本掌握了四川双生子的出生情况,增加了双生子研究资料与对象,为课题持续进行奠定了基础。 基金资助下,培养四川省学科带头人后备人选1人,青年骨干教师2名,硕士2名(毕业1名,在读1名),课题组成员参加学术及培训会议 3 人次;发表学术论文 4篇,核心 2篇,基本完成预期计划。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 5
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
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