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用基因芯片技术研究胰腺癌肝转移的相关基因群及基功能
  • 项目名称:用基因芯片技术研究胰腺癌肝转移的相关基因群及基功能
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:30000160
  • 申请代码:H1617
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2001-01-01-2002-12-01
  • 项目负责人:金钢
  • 负责人职称:讲师
  • 依托单位:中国人民解放军第二军医大学
  • 批准年度:2000
中文摘要:

本项目采用基因芯片及双向抑制消减杂交(SSH)这二种当今最新的研究手段,高效率、高通量筛查在胰腺癌发生、发展及肝转移过程中与肿瘤转移特异性相关的基因群。我们应用含有4096条人类全长基因的cDNA表达谱芯片对9例胰头导管腺癌标本组织的基因表达谱进行研究,筛选出差异表达基因184条,其中有11条尚未在GenBank登录的人类新基因。应用分层聚类技术,对9例胰头癌患者的芯片表达谱数据及术后随访资料进行聚类分析,结合其肿瘤转移、复发及预后进行分析,筛查出一组与胰腺癌患者肝转移及预后情况相关的基因,其中主要为胃肠肽类激素相关基因、细胞信号传导相关基因及细胞骨架及运动蛋白相关基因。这些基因有可能成为预测胰腺癌患者转移及预后的标靶基因。我们用人胰腺癌细胞株SW1990建立了裸小鼠胰腺原位移植及肝转移模型,将胰腺移植瘤及肝转移瘤细胞培养后抽提总RNA及mRNA,行双向抑制性消减杂交,获取消减cDNA文库,菌液斑点杂交筛选,取斑点杂交初步筛选的阳性克隆测序,经生物物信息学分析后筛选出58条转移相关基因,其中有9条为新基因。在筛选出的新基因中,我们命名一条新的S100P基因,已在GeneBank数据库中登录(登录号AF539739)。

结论摘要:

英文主题词Rancreatic cancer ,cDNA microarray ,tumor metastasis


成果综合统计
成果类型
数量
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