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通过DNA聚合剪切放大体系提高RNA的检测灵敏度
  • ISSN号:1672-6987
  • 期刊名称:《青岛科技大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:R392[医药卫生—免疫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]青岛科技大学化学与分子工程学院,山东青岛266042
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(21025523);国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2010CB732404);长江学者与创新团队计划项目(PCSIRT)
中文摘要:

基于循环的DNA剪切循环放大分子机器构建了一个RNA传感器。该分子机器以RNA为输入,产生大量的DNA片段,并替换报告探针上的荧光DNA从而产生荧光信号,实现对靶RNA浓度的放大检测。本分子机器分为两部分,反应部分和报告部分。在反应部分,以靶RNA为输入条件,以一个特殊设计的探针为反应模板引发一个自发连续的DNA聚合-剪切反应网络,重复产生大量信号DNA链;这些信号DNA链进入报告部分,通过杂交替换反应从一个报告探针上替换下带有荧光DNA序列,释放到溶液中。这样通过剪切产生的大量DNA适体序列被释放到溶液中,并替换报告探针上的荧光DNA,实现信号的放大。

英文摘要:

An RNA sensor was constructed based on a cycling DNA molecular machine that coupled DNA polymerization and restricted nicking.This molecular machine took RNA strand as the input,and produced reporting RNA strands with much amplified concentration(compared to the inputted RNA strand),which replaced the fluorescence signal strand in a fluorescence probe to produce fluorescence signal.This system was involved the cycling of the DNA polymerization and nicking,forming a cycling system.In this amplification system,aprobe with two strands was used,with one strand for the production of the signal DNA strand,while the other for the recognition of the target RNA and the cycling of the DNA polymerization and restricted nicking.These two reactions were repeated due to the cycling of the target RNA strand on the second strand;and the cycling increased the throughput of the molecular machine,thus bringing forth even more amplification.In this system,the optimal condition for the DNA polymerization-RNA transcription was explored.

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期刊信息
  • 《青岛科技大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:山东省教育厅
  • 主办单位:青岛科技大学
  • 主编:马连湘
  • 地址:青岛市松岭路99号
  • 邮编:266061
  • 邮箱:xbzr@qust.edu.cn
  • 电话:0532-88959017 88959018
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-6987
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1419/N
  • 邮发代号:24-233
  • 获奖情况:
  • 中国高校优秀科技期刊,全国石油和化工行业优秀期刊,全国高校优秀编辑质量奖科技期刊,华东地区优秀期刊,山东省优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:3384